A agricultura, ao longo dos milênios, experimentou mudanças marcantes, sendo a Revolução Verde uma fase que, apesar de promover avanços, introduziu práticas prejudiciais ao meio ambiente, como monoculturas intensivas e agrotóxicos. Em busca de alternativas sustentáveis, pesquisadores têm voltado sua atenção para sistemas agroflorestais (SAFs), que integram plantas agrícolas e florestais para promover benefícios ambientais e sociais. A literatura destaca a falta de estudos específicos sobre quintais agroflorestais. Os quintais agroflorestais, gerenciados por agricultores familiares e povos originários, destacam-se como modelos sustentáveis que são também capazes de atender a necessidades nutricionais e econômicas. Além de benefícios práticos, há uma relevância cultural e social nas práticas agroflorestais, na medida em que conhecimentos ancestrais são reconhecidos e mobilizados, o papel das mulheres no manejo dos sistemas agroflorestais é valorizado e gera-se renda para comunidades locais. Apesar de sua importância, a escassez de pesquisas sobre quintais agroflorestais limita o conhecimento a seu respeito e o apoio de políticas públicas para sua promoção. Estudos de casos indicam que esses quintais podem enriquecer o solo, contribuindo para a fertilidade e produtividade do agroecossistema. Portanto, mais pesquisas ecológicas abrangentes são necessárias para compreender a disponibilidade de nutrientes nesses sistemas. À luz dessa necessidade, o objetivo do estudo é revisar de forma sistemática o conhecimento disponível na literatura científica sobre a disponibilização de nutrientes em solos de quintais agroflorestais. O estudo utilizou a revisão sistematizada como um método rigoroso que preserva elementos centrais de uma revisão sistemática, ao passo em que ajusta os procedimentos às possibilidades de um estudo menos extenso. Foram empregados para o levantamento da literatura as bases Google Scholar, Scielo, Scopus e Web of Science, com buscas feitas em português, espanhol e inglês, no período de 1992 a 2023. Combinações específicas de palavras-chave (strings) foram utilizadas para filtrar artigos, teses e dissertações sobre análise química, ciclagem e disponibilidade de nutrientes em quintais agroflorestais. A análise dos dados envolveu codificação e categorização do corpo de trabalhos selecionados, de modo a extrair temas amplos que possibilitassem a construção de um entendimento sistematizado da disponibilidade e transferência de nutrientes nos solos desses quintais, conforme o conhecimento disponível na literatura científica. Foram examinados 17 documentos, gerando-se 329 registros de análise e 27 códigos. Os principais temas incluíram disponibilidade de carbono (11,5%), água (6,6%) e fósforo (9,5%). Os estudos abrangeram quintais no Brasil, Índia, Bangladesh, Peru e Etiópia. A partir dos resultados da revisão sistematizada realizada no presente estudo, podemos concluir que quintais agroflorestais, principalmente em ambientes tropicais, podem impactar positivamente na disponibilidade de nutrientes no solo, como fósforo, potássio, carbono e nitrogênio. Além disso, os resultados mostram como a presença de matéria orgânica e o manejo agroflorestal são cruciais, principalmente em solos ácidos, bem como que os nutrientes tendem a se concentrar em camadas superficiais, sendo influenciados por diversos fatores além do manejo, como a presença de alumínio, acidez, chuva e altitude. Esse estudo é importante para o entendimento de nutrientes que são disponibilizados em solos de quintais agroflorestais e como ocorre essa disponibilização de nutrientes.

Os microplásticos são peças ou fragmento de plástico menores que 5 mm e maiores que 1μm. O plástico quando utilizado em quantidade elevada, chega ao meio ambiente através do descarte inadequado causando a sua degradação. Devido a sua afinidade com poluentes orgânicos, podem servir como via de dispersão e contaminação, além do potencial de danos mecânicos no trato digestivo de animais quando ingerido. Devido a estes riscos e à sua grande disponibilidade no meio ambiente, o microplástico está se tornando uma ameaça pra toda a cadeia trófica. Neste presente estudo, tivemos como objetivo investigar o acúmulo de microplásticos em poças de maré de recifes de coral, bem como a relação da quantidade de microplásticos no sedimento e no organismo Zoanthus sociatus em praias de Salvador e Litoral Norte da Bahia. Para isso, realizou-se amostragens em nove pontos de coleta, nos quais foram coletados nas poças e em praias adjacentes, utilizadas como controle. Este estudo identificou 73% de partículas plásticas encontradas em sedimento de praia e poça, além de 27% de partículas plásticas encontradas no organismo Zoanthus sociatus. Com esse resultado, podemos dizer que foram encontrados microplásticos em todos os pontos de amostragem. A espectroscopia de infravermelho com transformada em Fourier (FT-IR), técnica utilizada no estudo identificou os polímeros Poliuretano (PU), Polipropileno (PP), Nylon e Polietileno tereftalato (PET).

A plasticidade fenotípica pode tanto dificultar quanto facilitar a evolução genética, afetando assim a macroevolução. No entanto, os mecanismos e associações da plasticidade fenotípica com padrões de biodiversidade permanecem não resolvidos. Neste artigo, investigamos o efeito da plasticidade fenotípica na evolução adaptativa no contexto de mudanças climáticas e presença dos custos da plasticidade, examinando especificamente as taxas de evolução de características, especiação, extinção e diversificação. Utilizamos um modelo baseado em agentes ecoevolutivo, incorporando a temperatura corporal como uma característica plástica que responde dinamicamente às flutuações na temperatura ambiental. Encontramos o mesmo padrão de resultados para ambos os contextos climáticos e de custos. Observamos que um aumento na plasticidade leva a uma diminuição nas taxas de extinção e evolução de características. Sistemas com espécies que exibem plasticidade experimentam taxas de especiação mais altas. Além disso, à medida que a plasticidade aumenta nos sistemas, as taxas de diversificação também aumentam. Nosso estudo apoia a hipótese de que a plasticidade pode facilitar a evolução adaptativa, fornecendo novos insights sobre o efeito da plasticidade na evolução adaptativa em escalas maiores, considerando mecanismos e fatores relevantes, como tamanho populacional, agrupamento, ocupação, extensão da plasticidade e dispersão.

A poluição antropogênica, muito comum em ambientes costeiros, tem origem nos esgotos domésticos e urbanos, sendo caracterizada pelo excesso de nutrientes na água. A impermeabilização do solo, aumenta a vasão de água doce sobre os sistemas costeiros, além de provocar maior incidência de pisoteio sobre macrofauna incrustante. Os moluscos bivalves, de forma geral, têm importância socioeconômica para muitas famílias nas regiões costeiras no Brasil. Apesar de alguns grupos de menor tamanho não serem aproveitados na alimentação, principalmente Brachidontes exustus devido à pouca carne disponível, possuem uma relevância ecológica como organismos bioengenheiros de sistemas costeiros. São considerados espécies-chave desses ecossistemas, pois regulam a disponibilidade de locais e micro-habitats para a macrofauna associada, atraindo uma variedade de
organismos bentônicos, abrangendo Poliquetas, Platelmintos, Nematodas, Cirripedios etc. O principal objetivo desse trabalho é analisar como a antropização influencia os leitos de bivalves e sua macrofauna associada em praias rochosas em Salvador, Bahia. Assim como analisar os efeitos dos impactos causados por esgoto sobre bivalves de ecossistemas costeiros tropicais; avaliar os efeitos da influência antrópica sobre a cobertura de mexilhões e outros grupos bentônicos; identificar a fauna associada e o efeito da antropização sobre bivalves e fauna associada de praias urbanas tropicais. A tese foi dividida em quatro capítulos: um capítulo teórico e dois empíricos. O primeiro foi uma revisão bibliométrica realizada de forma sistemática, onde constatamos que os métodos químicos foram mais priorizados que os métodos ecológicos, pelo menos na região tropical em nossa busca. O segundo capítulo analisa o efeito da antropização sobre a porcentagem de cobertura de bivalves e a presença de espécies associadas, utilizando a balneabilidade e a urbanização como medida antrópica. Identificamos 13 espécies associadas aos leitos de B. exustus e Isognomon bicolor, a cobertura de bivalves exerceu efeito positivo sobre três delas (Chthamalus sp. (Cirripedia), Balanus sp.  (Cirripedia). e Echinolittorina lineolata (Gastropoda)) e negativo em outras três Echinometra lucunter (Echinoidea), Fissurella sp. (Gastropoda) e Zoanthus sociatus (Hexacorallia). A cobertura total de bivalves e a presença de B. exustus foram maiores em ambientes mais antropizados, sendo relacionados negativamente com a balneabilidade e positivamente com a cobertura urbana. O terceiro capítulo identificou os táxons encontrados em associação com bivalves, e analisou a influência da antropização na densidade total de bivalves e táxons associados. A antropização foi avaliada através da seleção de modelos utilizando Generalised Additive Mixed Models (GAMM), enquanto o efeito de B. exustus na abundância da fauna associada foi analisado utilizando Generalized Linear Models (GLM). Encontramos uma abundância total de 78.028 organismos e uma riqueza total de 30 táxons nos leitos de bivalves, com destaque para poliquetas e gastrópodes. Os modelos de melhor ajuste foram os modelos nulos, indicando uma explicação limitada das variáveis antropogênicas na abundância da macrofauna associada B. exustus. No entanto, os modelos GLM mostraram que a abundância de B.  exustus tem efeito significativo positivo para a maioria dos táxons, evidenciando a influência desses bivalves como substrato biológico. Ressaltamos a complexidade em isolar os efeitos antrópicos dos estressores naturais, pois o costão é um ambiente naturalmente perturbado. É crucial investigar a variação dos padrões de biodiversidade ao longo do tempo, analisando as mudanças de distribuição dos bivalves e as pressões antropogênicas em comparação com áreas não urbanizadas.

Toxoplasma gondii é um parasita de relevância zoonótica, atuando na interface aves e mamíferos, incluindo o ser humano. Os cães têm sido utilizados como sentinelas para estimar a infecção por T. gondii no ambiente devido ao seu comportamento e proximidade com as pessoas. Porém, ainda falta informação acerca de variáveis socioambientais associadas a este parasita em comunidades vulneráveis. Por isso, nosso objetivo foi avaliar quais são os fatores demográficos e ambientais associados à soroprevalência de T. gondii em cães domésticos e sua distribuição espacial em bairros vulneráveis de Salvador. Este estudo foi realizado no bairro Marechal Rondon (MR) e Pau da Lima (PDL) entre outubro de 2021 a fevereiro de 2023 onde foram coletadas amostras de soro de cães domésticos e aplicados questionários eco-epidemiologicos a seus tutores. A detecção de anticorpos foi realizada por meio de ensaio de imunofluorescência indireta (IFI) com ponto de corte de 1:50. Foram coletadas amostras de 173 cães em MR e 115 em PDL. A soroprevalência em MR foi 30,6% e em PDL foi 47,0%. Utilizando modelos generalizados mistos (GLMM) identificamos que os cães com alimentação mista têm 50% menos de chances de serem expostos a T. gondii em comparação com os alimentados só com comidas caseiras, já os alimentados só com ração têm 80% menos de chances. Também que em PDL foi duas vezes maior que em MR e, finalmente, a probabilidade de exposição poderia aumentar nos animais senis e diminuir nos filhotes e juvenis comparados com os adultos. A distribuição espacial mostra regiões de alta densidade de indivíduos soropositivos e titulações. A soroprevalência de T. gondii em cães domésticos demonstra o contato com o parasita e seu papel como sentinela nas comunidades já que indica um potencial risco de exposição. Variáveis socioambientais dos bairros e a alimentação foram os principais fatores associados e evidencia a importância da comunicação e educação sobre os modos de transmissão de zoonoses para as pessoas e os animais de estimação nas comunidades vulneráveis.

O estoque de carbono é um serviço ecossistêmico, um dos vários benefícios
fornecidos pela natureza. As ações antrópicas, principalmente em virtude do
crescimento econômico por meio de implantação e manutenção de empreendimentos,
têm sido responsáveis pela perda e comprometimento dos benefícios provenientes de
serviços ecossistêmicos. Esta pesquisa objetivou mensurar o passivo ambiental de perda
de um dos mais importantes serviços ecossistêmicos desempenhados pelas florestas
tropicais, o estoque de carbono, na área de implantação do Porto Sul, um grande
complexo portuário que encontra-se em sua fase de instalação no município de Ilhéus
no interior da Bahia. Mapeou-se diferentes fitofisionomias presentes na área de
influência do empreendimento, destacando-se floresta em estágio inicial e médio de
regeneração, restinga, mangue e agroflorestas de cacau (Theobroma cacau) em um
sistema tradicional regionalmente conhecido como cabruca. Para cada fitofisionomia a
biomassa acima do solo foi calculada por meio de equações alométricas e a ferramenta
Empirical Bayesian Kriging foi utilizada como método de interpolação geoestatística.
Após a quantificação da biomassa acima do solo, precificou-se o total de carbono
encontrado em cinco cenários de preço diferentes e adicionou-se à análise econômica o
preço do produto florestal madeireiro e o de restauração para se chegar ao custo de
oportunidade do empreendimento. A média de estoque de carbono por fitofisionomia
foi de 2,77 t/ha-¹ para cabruca, 2,90 t/ha-¹ na floresta em estágio inicial de regeneração,
3,39 t/ha-¹ na floresta em estágio médio de regeneração, 2,06 t/ha-¹ restinga e 3,15 t/ha-¹
mangue. O preço do carbono teve uma variação de U$ 44,402.05 tC/ha/ano à U$
1,291,696.00 tC/ha/ano, o preço do produto florestal madeireiro foi de U $58,541.26 e o
custo médio por hectare para restaurar a área com vegetação nativa foi de U$2,562.91,
cabruca U$31,583.40, restinga U$2,978.83 e no mangue U$2,976.80. Assim, foi
possível quantificar e precificar um dos vários serviços ecossistêmicos afetados com a
chegada do Porto Sul no município de Ilhéus. Mensurar os passivos ambientais desses
empreendimentos são fundamentais para o monitoramento dos efeitos das ações
humanas na biodiversidade, concomitante a isso a análise econômica avalia em uma
esfera social uma das consequências da degradação desses ecossistemas.

O aumento da interação entre as populações humanas facilitou a dispersão de espécies exóticas, e o tráfego de embarcações é apontado como o principal responsável pela invasão de organismos nos ambientes marinhos. Nas últimas décadas, o coral-sol, nome popular dado a algumas espécies do gênero Tubastraea, ganhou destaque como espécie invasora na costa brasileira e desde então vem se dispersando cada vez mais. Neste trabalho, detalhamos quais condições esse grupo se encontra e sua atual distribuição geográfica na Baía de Todos os Santos (BTS) - BA, um local de grande importância ecológica e econômica para toda a região. Foram realizadas expedições ao longo de toda a BTS, utilizando a metodologia de vídeo-transecto, e os resultados mostraram que o complexo coral-sol se encontra amplamente distribuído, desde as regiões mais internas até as mais externas da baía. Usando os dados de cobertura e densidade, mostramos que há preferência por substratos artificiais e superfícies verticais e negativas. Além disso, um alto número de colônias foi encontrado em grandes profundidades. Interações interespecíficas com alguns grupos também foram evidenciadas. No atual estado, sugerimos que os esforços sejam voltados para a continuidade do monitoramento, no controle de populações em recifes de corais e em estudos que visem investigar se existem impactos, por parte dessas espécies, nas funções e serviços ecossistêmicos. Dessa forma, teremos preciosas informações não só para a gestão e mitigação dos impactos na BTS, como também para outras localidades.

A leptospirose continua a ser um grave problema de saúde nas comunidades urbanas empobrecidas dos países em desenvolvimento. A presença de corpos d`água poluídos e esgotos a céu aberto contribui para contaminação ambiental pela bactéria Leptospira e na abundância de roedores, representando a principal fonte de exposição dos residentes destas localidades. A não efetividade dos programas de controle de roedores e a ausência de intervenções sanitárias contribui para elevada incidência da infecção por Leptospira. Uma vez implementadas intervenções sanitárias e/ou de esgotamentos seus impactos deverão ser avaliados para compreender seus efeitos na transmissão de doenças, como no caso a leptospirose, e na saúde ambiental. Este trabalho, trata-se de um estudo para avaliar o impacto de intervenções sanitárias governamentais e comunitárias na carga ambiental da Leptospira no ambiente, na presença de ratos e na infecção por Leptospira na cidade de Salvador, Brasil. No primeiro capítulo, evidenciamos que  intervenção em esgotamento reduz locais de refúgio e movimentação dos ratos diminuindo a chance da sua presença nestes locais. No entanto, a intervenção realizada não reduziu as taxas de incidência de infecção por Leptospira, uma vez que, a exposição dos residentes não variou entres os períodos antes e após a intervenção, limitando a compreensão do efeito da obra na carga da doença. No capítulo dois, mostramos que intervenções governamentais de fechamentos dos esgotos reduzem a carga de leptospira no ambiente. A canalização e tamponamentos dos esgotos e corpos d’água evitam transbordamento durante as fortes chuvas fazendo com que toda a água seja direcionada, reduzindo a contaminação do solo. Intervenções sanitárias integradas, com a comunidade local em conjunto a outras ações de serviços básicos urbanos, coleta de lixo, pavimentação e drenagem pluvial, podem ser fundamentais na redução da carga do patógeno e da transmissão. Neste estudo, propormos um protocolo de avaliação de intervenções governamentais de esgotamento com participação social (capítulo três). Este modelo de intervenções coparticipativas em saneamento, ou seja, integrar os tomadores de decisão com a comunidade local poderá contribuir para efetividade na redução de doenças ambientais multifatoriais. Adicionalmente, avaliamos como as restrições provocadas pela pandemia de COVID-19 afetou a circulação de reservatórios zoonóticos, ratos, dentro de uma comunidade urbana de Salvador-Ba (capítulo quatro).  Constatamos um aumento no avistamento de ratos durante o período pandêmico, o que pode representar um risco de leptospirose, reforçando a necessidade ações urgentes de controle do reservatório e da doença nessas comunidades. Por fim , sugerimos intervenções abrangentes e integradas de saneamento, estas ações podem contribuir para a lacuna de como estas ações podem impactar os mecanismos de transmissão e a carga de infecção por Leptospira nos residentes, assim como direcionar futuras intervenções com efeitos duradouros em outros locais no mundo.

Resolver se a idade das espécies está associada à probabilidade de extinção tem o potencial de ajudar nosso entendimento sobre as dinâmicas de extinção nos clados vivos ou extinctos. O estudo deste padrão é conhecido como extinção dependente da idade (ADE, siglas em inglês), e não há consenso teórico ou empírico sobre o sentido da relação. Nesta tese propomos, como primeiro capítulo, a teoria de substituição de clados (CRT, siglas em inglês) como uma estrutura teórica que considera aspectos ecológicos e evolutivos dos clados para gerar predições testáveis sobre o ADE. Durante o estudo de ADE percebemos que há uma diferença conceitual entre a idade definida pela paleontologia e pela neontologia. Além disso, esta última, já que é estimada por meio do comprimento dos ramos das filogenias, possui fontes de incerteza. Por consiguinte, como segundo capítulo, através de simulações, avaliamos as taxas de erro na estimação das idades filogenéticas associadas com modos de especiação e distintos cenários de extinção. Propomos também uma abordagem para corrigir as estimativas de idade sob a presuposição de uma especiação bifurcativa. Formalizamos o CRT com dois proposições. A primeira é efeito de incumbência por parte um clado antigo sobre o espaço de nicho, o que limita a diversificação e dominância dos clados novos. Devido à colonização e subsequente rápida diversificação do clado antigo sobre o espaço de nicho, particionando ele, nos hipotetizamos que essa trajetória de ocupação de nicho geraria uma tendência das espécies mais antigas a ocupar as posições de nicho mais centrais. Como terceiro capítulo, exploramos dita hipótese no contexto dos tetrápodes neotropicais. Encontramos, que para esses grupos, não há generalidade nesta relação, porém os grupos significativos, apoiaram nossa expectativa. A segunda proposição do CRT é uma mudança ecológica que afeta o fitness do clado antigo oferecendo uma oportunidade para o clado novo diversificar e virar dominante. A partir dessas duas proposições, nos hipotetizamos que o sentido do ADE estará definido pela mudança ecologica. Se esta não acontecer, o ADE será negativo, i.e., espécies mais antigas possuirão menor probabilidade de extinção. Se esta acontecer, o ADE será positivo, i.e., espécies mais novas possuirão menor probabilidade de extinção. 

Durante os últimos 50 anos, a urbanização assumiu novas formas de desenvolvimento e teve seu ritmo acelerado devido ao aumento da população urbana e dos ambientes construídos, contribuindo para modificações irreversíveis nos ecossistemas, paisagens e biosfera. O entendimento de como as modificações constantes na paisagem urbana afetam a biodiversidade local, especialmente, como a abundância e riqueza das espécies são alteradas nesses ambientes, tem sido um dos maiores desafios para os pesquisadores que trabalham na área de conservação. Abelhas e vespas solitárias que nidificam em cavidades preexistentes são conhecidas por serem bioindicadoras sensíveis às mudanças ambientais, além de possuírem grande importância na conservação ambiental. Com base nisso, analisamos o efeito da intensidade da urbanização sobre a composição, riqueza, taxa de parasitismo, mortalidade e emergência de machos e fêmeas das comunidades de abelhas e vespas solitárias que nidificam em cavidades preexistentes dentro de um gradiente de paisagens urbanas e naturais na cidade de Salvador e Região Metropolitana, na Bahia, Brasil. Ninhos-armadilhas foram instalados em 24 pontos amostrais ao longo do perímetro urbano e periurbano de Salvador e Região Metropolitana, com raio de 1 km analisados em relação à estrutura da paisagem em cada ponto amostral, e com estimativa da percentagem de cobertura impermeável. De um total de 36.720 ninhos-armadilha disponibilizados em campo, 879 ninhos foram ocupados por abelhas (n= 350) e vespas (n= 529). Dos ninhos ocupados pelas abelhas e vespas, um total de 3899 indivíduos emergiram, contabilizando 1501 abelhas, 2257 vespas e 197 outros inimigos naturais que emergiram dentro dos ninhos ocupados pelas abelhas e vespas. Os resultados levantados suportam parcialmente nossa hipótese de que a urbanização exerce influência negativa, atuando como um fator limitante sobre as comunidades de vespas e abelhas solitárias que nidificam em cavidades preexistentes, com menor diversidade e taxas de parasitismo registradas em áreas com os níveis mais altos de urbanização, no entanto, a abundância de ninhos, a taxa de mortalidade e de emergência de fêmeas e machos parecem não ser diretamente influenciadas pela urbanização, sugerindo que outros fatores estariam modulando suas respostas, como a disponibilidade de recursos alimentares, como fontes florais para as abelhas e de presas para as vespas. Observamos ainda uma ação temporal dos impactos resultantes da urbanização nas comunidades desses insetos. Essas questões sugerem que, para capturar os efeitos reais da urbanização sobre as comunidades de insetos que nidificam em cavidades preexistentes, são necessárias observações a longo prazo para documentar mudanças temporais e sazonais nos inventários de espécies ao longo do tempo. Para uma visão mais completa dos efeitos da urbanização nas comunidades de vespas e abelhas, métodos de amostragem complementares devem ser encorajados em estudos futuros.

Os eventos de bioinvasão são uma das principais causas de perda de diversidade nos ambientes coralíneos, sendo uma preocupação mundial. Considerando que ações de erradiação de espécies invasoras têm maior chances de sucesso nos estágios iniciais de sua introdução, é fundamental o desenvolvimento de métodos de monitoramento que efetivos e mais rápidos de detecção, de preferência ainda no estágio inicial de infestação. No presente trabalho, realizamos a comparação de três diferentes protocolos de monitoramento utilizados no Brasil para a detecção de bioinvasões marinhas, dois planejados para o monitoramento de comunidades, o protocolo ReBentos/AGRRA e o Vídeo-Transecto e um focado na detecção de organismos bioinvasores, o DAFOR. O objetivo do trabalho foi investigar qual destes protocolos teria o menor limite de detecção, este possibilitaria uma detecção mais efetiva e rápida dos organismos não nativos em ambientes de bioinvasões recentes. Contudo, não encontramos diferença significativa entre os limiares mínimos de detecção dos protocolos nas condições amostradas. Os métodos de monitoramento podem ser considerados equivalentes entre eles na eficiência da detecção precoce de bioinvasões marinhas em recifes de coral. Entretanto ressaltamos que as condições de execução do trabalho pode impor limitações na interpretação de seus resultados. O tamanho das parcelas (30 X 30m) foi bem menor do que um sítio real de levantamento ou monitoramento ambiental, o que torna o esforço amostral bem menos representativo do que na realidade. A cobertura da espécie alvo nos sítios de amostragem não apresentou coberturas condizentes com a de um início de invasão, quando a espécie ainda poderia ser considerada rara.

As vocalizações emitidas pelas aves são classificadas como canto ou chamado, e estão frequentemente associadas a escolha de parceiros, defesa de território e alarmes. Sendo um meio de reconhecimento intraespecífico, a variação na vocalização das aves pode atuar como barreira pré-zigótica e atuar no processo de especiação. A maior parte da informação que possuímos sobre a variação vocal das aves advém de estudos com aves que aprendem seu canto, os oscines. Neste estudo, avaliamos a variação geográfica de dois tipos de vocalizações (canto (dawn song) e chamado (day song) de Attila rufus, tiranídeo endêmico da Mata Atlântica brasileira, que  apresenta duas subespécies descritas com base no padrão de coloração da plumagem. Deste modo, nosso estudo teve o interesse em responder as seguintes questões: (i) Existe variação geográfica em day e dawn song para Attila rufus? Em caso positivo, ela apresenta padrões diferentes entre as duas vocalizações? (ii) A variação vocal está correlacionada aos efeitos da seleção ecológica (vegetação e clima) e/ou à deriva (isolamento por distância)?; (iii) As subespécies de Attila rufus exibem diferenciação vocal? Os resultados das análises descriminantes não revelaram estrutura acústica para o espaço multivariado que corroborasse as espécies descritas, concordando com a ausência de estrutura populacional anteriormente exibida por estudos moleculares.  Apenas dois parâmetros da terceira nota de day song exibiram relação significativa com o habitat, mais precisamente a variação da temperatura, corroborando com a hipótese da adaptação acústica. Nossos resultados indicam: (i) variação vocal similar entre as subespécies, sem assinatura vocal distinta; (ii) habitat e distância geográfica não explicam de forma significativa a variação vocal em A. rufus; (iii) entre as variáveis do habitat, apenas temperatura exibiu efeito em parâmetros espectrais restritos. Sugerimos que analises de variação de plumagem ao longo da distribuição da espécie sejam realizadas para se confirmar ou rejeitar o padrão aqui observado.

Ratos urbanos representam um desafio à saúde pública, principalmente como reservatórios de patógenos de importância humana. Os esforços de controle e erradicação globais são focados em controle letal a base de rodenticida, uma medida de curta duração que permite a recuperação das populações com o tempo. Estudos da ecologia destes roedores são fundamentais para desenvolver programas de controle mais eficientes e guiar a implementação local dos mesmos. O presente estudo avaliou aspectos de ecologia de paisagem e demografia de ratos urbanos no contexto de uma área endêmica de leptospirose em salvador. A infestação por ratos em salvador está ligada a recursos associados à infraestrutura urbana precária e pobreza urbana. Os serviços urbanos básicos (coleta de lixo, visitas de agentes de saúde e campanhas rodenticidas do ccz) necessitam ser melhor avaliados em seu papel no controle e prevenção da transmissão de zoonoses associadas a roedores. Há uma lacuna grave na literatura quanto a estudos de avaliem empiricamente a efetividade de campanhas rodenticidas como medidas de prevenção de zoonoses. Por fim, propõe-se uma escala preditiva de risco de casos graves de leptospirose com base em sinais de infestação.

Em abordagens de conservação e uso sustentável da biodiversidade, tem sido comum a proposta de integração de conhecimentos acadêmicos e indígenas ou locais. Pesquisas em etnoecologia e etnobiologia adquirem importância central em tais propostas de integração, bem como em iniciativas de diálogo, pois permitem entender como comunidades locais compreendem organismos e ecossistemas, o que não somente possibilita mobilizar conhecimentos potencialmente importantes na conservação da biodiversidade, mas também criar condições mais favoráveis para que essas comunidades tenham voz e participem dos processos de decisão sobre conservação. Portanto, nesta tese discutimos potencialidades e limitações do diálogo entre sistemas de conhecimento e dos processos de coprodução de conhecimentos em Siribinha, uma comunidade de pescadores e marisqueiras artesanais do litoral norte da Bahia. Siribinha, assim como outras comunidades pesqueiras do Brasil, sofre várias ameaças ambientais, sociais e econômicas. Diante dessas ameaças, é importante realizar estudos que documentem os corpos de conhecimentos e práticas dos pescadores e das marisqueiras, contribuindo, assim, para a preservação da sua identidade, bem como para o reconhecimento de sua contribuição para a conservação da biodiversidade. Portanto, discutimos a necessidade de que tenham voz em decisões sobre conservação, especialmente em seus territórios. Assim, o presente estudo busca analisar o conhecimento local dos pescadores e das marisqueiras de Siribinha acerca de aspectos biológicos e ecológicos dos peixes com os quais interagem, bem como a taxonomia local relativa a esses organismos. Buscamos construir um entendimento dos seus sistemas de conhecimentos e práticas, que possa informar o estabelecimento de processos dialógicos entre os sistemas de conhecimento pesqueiro artesanal e científico-acadêmico no domínio da conservação e do uso sustentável de recursos. Para tanto, utilizamos como métodos a listagem livre, entrevistas semi-estruturadas e tarefa de tríades. Nossos resultados mostram que a comunidade tem um rico conhecimento sobre peixes (com 197 etnoespécies registradas, das quais 33 foram detectadas como salientes). Porém, encontramos uma diversidade intracultural na forma como os peixes são classificados pelos membros da comunidade, o que exige cautela ao fazer suposições de que ela teria um modelo único a este respeito, que constituiria um consenso cultural. Mostramos também como o conhecimento de pescadores e marisqueiras artesanais pode ter uma relação de complementaridade com o conhecimento científico-acadêmico, mas também trazer tensões que precisam ser abordadas por meio de diálogo intercultural. Finalmente, mostramos a importância da incorporação do conhecimento local na formulação de políticas públicas, tais como aquelas relativas ao defeso. Dessa forma, podemos melhorar as práticas de manejo sustentável da biodiversidade e também contribuir para o empoderamento das comunidades tradicionais e povos indígenas.

Existem várias evidências do declínio mundial nas populações de abelhas polinizadores como consequência da homogeneização da paisagem devido ao uso intensivo do solo pela agricultura de larga escala. Estudos empíricos têm evidenciado que a comunidade de abelhas é afetada positivamente pelo aumento da heterogeneidade da paisagem. Esse efeito pressupõe que os indivíduos estão se movendo em busca de recursos complementares ou alternativos presentes em diferentes elementos que compõem a paisagem. No entanto, não há estudos que averiguaram o efeito da heterogeneidade da paisagem em diferentes níveis hierárquicos levando em consideração diferentes perfis de abelhas e seus padrões de movimentos em paisagens reais compostas por áreas agrícolas intercaladas por ambientes nativos naturalmente heterogêneos. Abordar empiricamente essa relação pode ser difícil com estudos de campo, por isso nesta tese foram utilizados modelos baseados em agentes para modelar um possível mecanismo de causa e efeito pelo qual a heterogeneidade da paisagem influencia as populações e comunidades de abelhas com diferentes características, levando em consideração seus padrões de movimentação. No primeiro capítulo desta tese foi criado um modelo que permitiu simular o comportamento de forrageio de diferentes perfis de abelhas e o balanço energético dos indivíduos em paisagens agro-naturais estruturalmente distintas. Essa modelagem permitiu criar um índice que refletisse a qualidade da paisagem do ponto de vista dessas abelhas e compara-lo com índices tradicionalmente utilizados para descrever a estrutura da paisagem. No capítulo 2 foi criado um modelo que utilizou como entrada o índice de qualidade da paisagem (criado no capítulo 1) para simular a dinâmica populacional através da capacidade de sobrevivência, abundância, reprodução e dispersão de diferentes perfis de abelhas para entender como a estrutura das paisagens agrícolas pode afetar a diversidade desses organismos ao longo do tempo. Além disso, para ambos os modelos foi explorada a capacidade preditiva dos modelos para a riqueza e abundância de abelhas amostradas em campo no Agropolo Mucugê-Ibicoara da Chapada Diamantina, Bahia, Brasil. Com esses modelos foi possível mostrar que o índice de qualidade da paisagem gerado pode ajudar a prever a abundância e riqueza de espécies das abelhas. Embora haja uma correlação considerável entre o índice gerado com a métrica de paisagem de proporção de ambiente nativo, parece que esse índice de qualidade da paisagem gerado explica uma porção diferente da variação e, portanto, pode ser incluído como um descritor complementar da paisagem. Também, foi verificado que a estrutura da paisagem é um aspecto importante, que interferiu na dinâmica das populações e estrutura das comunidades simuladas, onde abelhas com perfis altamente especializados em relação a preferência de ambiente para nidificação foram penalizadas em paisagens mais heterogêneas. Por fim, os modelos criados permitiram avaliar explicações mecanicistas para as relações causais entre os padrões das paisagens e a estrutura das comunidades de abelhas.

A infecção por hantavírus é uma doença zoonótica com elevadas taxas de morbimortalidade humana. O orthohantavírus de Seul (SEOV) é um patógeno, albergado por ratazanas (Rattus norvegicus) que pode ser transmitido diretamente, por contato físico entre reservatórios infectados ou indiretamente, com o ambiente como intermediário. Estudos avaliando a prevalência de SEOV em ratos em comunidades urbanas desfavorecidas, comumente denominadas de favelas. O objetivo deste estudo foi identificar a prevalência de SEOV em ratos em quatro comunidades urbanas de Salvador-Brasil. Posteriormente associamos o status de infecção por SEOV com variáveis demográficas e ambientais que contribuem para presença deste patógeno na população de roedores. O ensaio imunoenzimático (ELISA) foi usado para detectar anticorpos SEOV em ratos. Um total de 117 ratos da Rattus norvegicus foram capturados no estudo. Encontramos uma prevalência de infecção de 32% (37 dos 117 ratos capturados). A positividade de SEOV em ratos foi associada positivamente com a idade em dias do animal. Utilizando modelos Lineares generalizados identificamos que as fêmeas têm uma maior chance de ser positivas comparados aos indivíduos machos (a OR 4.62 IC 1.59 - 13.45)) e maturidade sexual teve um efeito positivo na infecção (a OR 6.27IC 1.39 - 28.27), sugerindo que encontros sexuais, ou comportamentos específicos como cuidado parental e defesa do ninho, podem ser uma fonte de infecção direta entre ratazanas de ambientes desfavorecidos tropicais. Materiais acumulados, especialmente materiais de construção, foram fortemente associados à presença de ratazanas positivas (aOR 6.44 IC 2.01 - 20.64). Isso implica em uma possível fonte de exposição para os humanos, uma vez que esses materiais oferecem abrigo para o reservatório. A alta prevalência do SEOV em ratazanas urbanas apresenta potencialmente um alto risco para a saúde humana. Os resultados aqui descritos fornecem informações sobre estrutura das infecções por SEOV na população reservatória de áreas desfavorecidas tropicais sendo úteis para repensar medidas preditivas de transbordamento humano.

A perda de habitat é a principal causa da perda contínua de biodiversidade em todo o mundo. Fundamentalmente, está cada vez mais claro que as perdas na cobertura florestal em escalas de paisagem resultam em mudanças substanciais em uma série de processos ecológicos e funções do ecossistema que, em última instância, determinam a trajetória futura de muitas das florestas mais diversas e ameaçadas do mundo. Objetivamos nesse estudo avaliar a resposta da riqueza taxonômica e diversidade funcional de plantas lenhosas da Mata Atlântica frente a perda de habitat na escala da paisagem. Esse estudo foi realizado em onze paisagens de 6 x 6 km (36 km²) com diferentes proporções de cobertura florestal (entre 5% e 60%) na Mata Atlântica da Bahia. Foram estabelecidas oito parcelas de 250 m² aleatoriamente escolhidas em cada paisagem, e amostrados ramos de todos os indivíduos lenhosos com circunferência acima do peito (CAP) igual ou superior a 8 cm. A classificação das espécies por característica funcional foi baseada em livros, dissertações, teses, artigos científicos e banco de dados ecológicos virtuais. A cobertura florestal na escala da paisagem afetou negativamente a riqueza taxonômica e funcional e essas relações foram não lineares. A uniformidade funcional não respondeu a quantidade de cobertura de floresta na paisagem. Já a divergência funcional respondeu positivamente dentro desse cenário. As características funcionais apresentaram respostas distintas a quantidade de floresta na paisagem, com as características associadas as espécies climácicas sendo fortemente afetadas pela perda de cobertura florestal. Contudo, ressaltamos que até mesmo as nossas paisagens mais desmatadas ainda detêm parte significativa da flora lenhosa da Mata Atlântica e podem ser importantes fontes de sequestro de carbono devendo ser consideradas nas políticas de manejos da biodiversidade da Mata Atlântica.

O decréscimo da biodiversidade dos principais polinizadores tem se mostrado preocupante para a segurança alimentar e o bem-estar humano por afetar diretamente a produção agrícola a partir da diminuição da estabilidade e resiliência das lavouras e áreas nativas em seu entorno. Essas consequências ocorrem, principalmente pela maioria das causas estarem ligadas ao desenvolvimento econômico, por exemplo, devido à expansão de áreas agrícolas, ao desmatamento e ao uso de agroquímicos nas extensas áreas de monocultura. Para solucionar esse problema, abordagens de manejo baseadas na conservação do serviço ecossistêmico da polinização estão sendo produzidas na academia. No entanto, apesar das contribuições ecológicas em relação à gestão de recursos ambientais localmente situados, estas abordagens mostram-se ineficientes na tomada de decisão, pois não dialogam com o que é importante e relevante para os atores sociais envolvidos. Situadas nesta lacuna em relação à tomada de decisão, abordagens comportamentais tendem a complementar essas abordagens ecológicas convencionais ao se debruçar sobre a compreensão do comportamento favorável à conservação dos atores sociais. Como complementação a essas abordagens, os métodos qualitativos fornecem uma compreensão diversa da complexidade do comportamento favorável à conservação dos agricultores e dos atores sociais, buscando uma compreensão robusta do comportamento e dos seus determinantes, levando em consideração as especificidades do contexto e podendo levantar questões que o pesquisador pode não ter levado em consideração por estar fora do contexto. No entanto, para pesquisas no campo da Ecologia, mais especificamente em relação às práticas que impactam a biodiversidade dos principais polinizadores, abordagens comportamentais de cunho qualitativo ainda são escassas. Nesse sentido, este trabalho buscou investigar, numa abordagem qualitativa, a relação dos construtos comportamentais com a intenção de agricultores e técnicos agrícolas envolvidos na produção de café da Chapada Diamantina, na Bahia, Brasil, de aplicar e promover formas de manejo do plantio com práticas de alto impacto e práticas agrícolas de baixo impacto à biodiversidade e ao serviço ecossistêmico da polinização. Foram realizadas entrevista semi-estruturadas on-line para investigar crenças associadas aos construtos comportamentais da atitude, norma subjetiva e controle comportamental percebido de cinco agricultores e dez técnicos agrícolas, segundo a Teoria do Comportamento Planejado de Icek Ajzen (TCP) da psicologia social. A partir das respostas, foi feita uma análise temática, utilizando como temas os construtos comportamentais da TCP. Para identificar a relevância de cada construto, o número de presença das categorias foi contabilizado para cada tipo de estratégia de manejo, sendo consideradas as categorias de forte relação aquelas que obtiveram 75% ou mais de citações nas respostas. Segundo os resultados, a Atitude, a Norma Subjetiva e o Controle Comportamental Percebido estão relacionados com as intenções de técnicos e agricultores de utilizar práticas de alto impacto e baixo impacto para o controle de pragas, doenças e manejo de ervas espontâneas. De acordo com as análises, concluímos que as principais influências no comportamento dos grupos entrevistados resultam da Atitude e da Norma Subjetiva, mostrando que a Intenção comportamental dos grupos entrevistados está associada a como eles avaliam as práticas e às influências sociais a que estão sujeitos. Os resultados encontrados neste estudo servirão como subsídios para uma pesquisa em andamento, a qual visa aumentar a disposição dos agricultores da Chapada Diamantina para adotar práticas agrícolas de baixo impacto à biodiversidade.

O comportamento sexual em muitas espécies de mosca-das-frutas é essencial para que os machos conquistem as fêmeas. Eles podem adquirir informações por meio de interações sociais e modificar seu comportamento no futuro para obter mais acasalamentos. Tem sido demonstrado que experiência sexual prévia e interações entre machos podem modificar o comportamento sexual deles, tornando-os mais aptos a conquistarem fêmeas em cortes subsequentes. A mosca-das-frutas Anastrepha fraterculus (Wiedemann, 1830) (Diptera: Tephritidae), uma praga agrícola, apresenta comportamento sexual complexo, no qual machos mantém interações com outros machos durante o comportamento de lek, podendo também acasalar com diversas fêmeas ao longo da vida. O estudo do comportamento de corte de A. fraterculus pode contribuir para o aprimoramento da Técnica do Inseto Estéril (TIE). Essa técnica consiste na produção e esterilização de milhões de machos em laboratório, sendo que estes devem ter uma alta qualidade e ser sexualmente competitivos, sendo capazes de acasalar com fêmeas selvagens, promovendo assim a redução gradual da população no campo. O objetivo deste trabalho foi analisar a competitividade e o comportamento de corte de machos mantidos em diferentes contextos sociais, a fim de determinar se um acasalamento prévio ou interações com outros machos podem alterar o comportamento sexual deles, possibilitando que estes sejam mais aptos a acasalar com fêmeas em cortes subsequentes. Os machos foram mantidos agregados ou isolados durante seu período de amadurecimento sexual, e esses dois grupos foram expostos ou privados de contato com fêmeas virgens, formando assim os quatro tratamentos testados: machos copulados agregados, machos copulados isolados, machos virgens agregados e machos virgens isolados. Foram realizados testes de competição sexual e filmagens do comportamento de corte com os quatro tratamentos de machos. Os resultados deste estudo mostram que machos de A. fraterculus previamente acasalados não apresentam maior competitividade sexual ou qualquer mudança no comportamento de corte que proporcionasse uma vantagem sexual em relação a machos virgens. Entretanto, foi possível determinar que machos que mantiveram interações sociais com outros durante seu período de amadurecimento sexual, apresentaram maior competitividade sexual do que machos que foram mantidos em isolamento e maior frequência de unidade comportamentais associadas a emissão de feromônios sexuais. Essa descoberta é importante para entender melhor como o comportamento de corte e cópula em A. fraterculus varia de acordo com as interações sociais que os machos têm durante seu amadurecimento sexual. Isso pode ser um fator importante, levando em consideração que um pré-requisito para o sucesso da TIE é que os machos estéreis liberados sejam sexualmente competitivos para acasalar com o maior número de fêmeas selvagens possível, induzindo assim a uma falha na reprodução dessa praga agrícola.

Por ter sua localização periférica, os manguezais foram menos estudandos do que outros
ecossistemas costeiros, a ecologia de ecossistemas de manguezais avançou desde o
estudo de Robertson (1986) que demonstrou resultados primordiais do papel
desempenhado por caranguejos grampsídeos nos manguezais, através da retenção das
folhas nas tocas. Atualmente é sabido que as galerias construídas pelos caranguejos para
abrigo e reserva de alimento, alteram a distribuição de partículas do sedimento,
aumentam a superfície de contato entre o ar e este espaço e alteram as condições redox,
temperatura e salinidade. Aliado a isto, evidências demonstram contribuição dos
caranguejos sesarmídeos e ocipodídeos nos processos de ciclagem de nutrientes no
ecossistema devido a retenção, maceração e enterro do lixo, do tapete de microalgas
epipilético e facilitação da comunidade bacteriana. Por outro lado, a vegetação
influencia na ocorrência de caranguejos bioturbadores, seja devido à preferência
alimentar destacada para algumas espécies vegetais ou pela oferta de abrigo e proteção
para construção das tocas. Sendo assim, o presente estudo teve por objetivo como a
biologia populacional de caranguejos sesarmídeos e ocipodídeos bioturbadores se
relaciona com o mangue,: (i) tendência dos estudos que relacionam estrutura de mangue
e população de caranguejos bioturbadores, (ii) veículos que mais publicaram o tema,
(iii) parceria entre autores e países, (iv) continentes dos locais de estudo (v) zonação,
(vi) espécie de caranguejo estudada, (vii) níveis biológicos (viii) coleta de sedimento,
(ix) principal método de coleta de caranguejo e vegetação.

Após eclodirem em ambiente terrestre, as tartarugas marinhas precisam alcançar o habitat marinho. Entretanto, como os filhotes se orientam para encontrar habitats adequados para desenvolvimento, estes que podem variar entre as espécies, ainda se configura como uma lacuna. Apesar das tartarugas adultas apresentarem habilidades quimiossensoriais para orientação em ambiente marinho, é possível que esse mecanismo seja a base da primeira migração de filhotes pós-eclosão. Entretanto, a quimiorrecepção é frequentemente prejudicada pela poluição química. Por exemplo, os filhotes que atraversam as águas costeiras podem encontrar aguas poluídas (química ou biologicamente) como resultado das atividades humanas (e.g., esgotamento doméstico urbano). Em uma espécie de tartaruga marinha (Caretta caretta), determinamos i) o papel da quimiorrecepção na escolha do habitat marinho (costeiro e oceânico), e ii) se a poluição química costeira interfere nesse mecanismo sensorial. Usando um tanque “Y”, que possibilita apresentar dois fluxos de água distintos concomitantes, as tartarugas estiveram livres para nadar em ambos os fluxos por um período total de 10 minutos. No primeiro experimento, os filhotes quase 70% do tempo na água oceânica. No segundo experimento, quando os filhotes tiveram que escolher entre água costeira e água poluída (coletada em uma praia com escoamento doméstico), não houve escolha entrepreferência pelo fluxo de água costeira ou costeira poluída. Contudo, essas evidências demostram o papel da quimiorecepcão na seleção de habitat e a falta de reconhecimento de condições potencialmente prejudicias (poluição) o que poderia comprometer a aptidão, por exemplo, caso haja maior mortalidade por contaminação.

Estudos de vocalizações de anfíbios em escalas locais tem expandido nosso entendimento ecológico sobre está importante característica do grupo. Todavia, ainda existe uma grande lacuna sobre como esses entendimentos sobre as vocalizações dos anfíbios em pequena escala se refletem em padrões geográficos e evolutivos em larga escala. Neste trabalho, utilizamos as espécies da família Phyllomedusidae para descrever os padrões espaciais e filogenéticos na vocalização do grupo, bem como compreender os fatores que afetam os diferentes parâmetros do canto dessa família. Especificamente, medimos a autocorrelação espacial e filogenética entre as espécies deste clado usando o autocorrelograma do I de Moran, também relacionamos o tamanho do corpo, temperatura e precipitação com a duração do canto, a frequência dominante e o pulso das vocalizações através de uma regressão linear múltipla. Nossos resultados mostraram uma baixa auto correlação espacial e filogenética indicando que as espécies desse grupo possuem uma baixa conservação das caraterísticas do canto ao longo da filogenia, e pouca estrutura espacial. A regressão mostrou uma relação negativa entre o tamanho de corpo e a frequência dominante, seguindo o padrão alométrico encontrado para outros anfíbios e vertebrados. Também foi observada uma influência positiva da temperatura sobre o número de pulsos emitido pelas espécies, possivelmente explicada por uma relação com a taxa de metabolismo, maior em regiões mais quentes em anfíbios. Em conjunto, os resultados desse trabalho apontam para uma rápida evolução e modificação das características relacionadas ao canto dos Phyllomedusidae, que ao mesmo tempo são restritas por fatores endógenos (tamanho do corpo) e exógenos (temperatura do ambiente).

As funções ecológicas são importantes para manutenção dos ecossistemas e podem ser

definidas como os papéis desempenhados pelos organismos no ambiente. A abordagem

funcional permite um melhor entendimento da influência dos organismos sobre o

funcionamento dos ecossistemas em relação a outras abordagens (e.g. classificação

taxônomica). As funções podem ser estudadas através dos traços funcionais dos

indivíduos e as propriedades do ecossistema (e.g. resiliência) dependem da distribuição

e abundância destes no tempo e no espaço. Contudo, diversos estudos têm utilizado

todos os traços e que não necessariamente estão associados a funções. Muitos estudos

realizados em ecossistemas estuarinos investigam a distribuição de táxons da

macrofauna bentônica e os padrões espaciais e/ou temporais. Entretanto, ainda é pouco

conhecida a distribuição das funções desempenhadas pela macrofauna ao longo deste

sistema. No presente trabalho, nossa hipótese é de que a composição funcional da

macrofauna bentônica não se altere significativamente ao longo dos gradientes e em

diferentes períodos, embora a composição taxonômica mude, uma vez que diferentes

táxons podem apresentar conjuntos de características similares para realizar uma mesma

função. Foi utilizado um lote de dados dos 3 principais estuários da Baía de Todos os

Santos (Jaguaripe, Paraguaçu e Subaé) ao longo de 10 ou 11 estações, amostrados em

pelo menos em 4 períodos diferentes. Primeiramente, foram levantadas as funções

ecológicas importantes para os ambientes estuarinos e estabelecidas combinações de

traços funcionais, diretamente relacionadas a funções ecológicas específicas.

Posteriormente, foram testadas potenciais diferenças na distribuição das funções entre

as zonas de salinidade dos estuários e ao longo dos anos. As funções ecológicas

consideradas importantes para os estuários foram bioturbação, fragmentação da matéria

orgânica, estabilização do sedimento, ciclagem de nutrientes e produção secundária. Um

total de 11 categorias de traços foram utilizadas para descrever as funções ecológicas,

incluindo: mobilidade, tipo de movimento, modo de alimentação, aparato utilizado para

entrega de alimento, presença de mandíbula, compartimento sedimentar, tamanho

corporal, modo de reprodução, idade da primeira reprodução, expectativa de vida e taxa

de fecundidade. De maneira geral foi identificado redundância funcional para os traços

associados a bioturbação do sedimento e ciclagem de nutrientes nas regiões mais

marinhas com característica de grãos mais finos enquanto que nas regiões a montante

dos estuários com presença de sedimento de grãos mais grossos foi identificado

principalmente traços associados a função de fragmentação da matéria orgânica. A

abundância de organismos com traços associados a estabilização de sedimentos foi

muito baixa e os conjuntos de características associadas à produção secundária parecem

aumentar à medida que a salinidade diminui. Nem todas as funções se mantiveram ao

longo do gradiente estuarino, devido a ausência de poliquetas com traços similares

capazes de compensar a perda de táxons em determinadas regiões. As funções

desempenhadas pelos poliquetas apresentaram diferenças entre as zonas de salinidade

do estuário (estuário Jaguaripe), assim como para interação entre os anos de coleta e as

zonas de salinidade (estuário Paraguaçu), e diferenças também entre os anos (estuário

do Subaé). Os resultados desse estudo contribuem para compreender o funcionamento e

manejo dos ecossistemas estuarinos. Estudos empíricos que testem a relação dos traços

funcionais descritos com as funções ecológicas mencionadas devem ser realizados para

que seja possível medir o real potencial dos traços funcionais dos organismos no

funcionamento dos ecossistemas.

Sistemas agroflorestais possuem ampla área de cultivo no sul da Bahia, representados por plantações de cacau sob o sistema tradicional de cultivo, as chamadas cabrucas. Nestas agroflorestas o cacau é cultivado sob a sombra de espécies florestais nativas, que servem de habitat para uma grande variedade de morcegos, entre elas as espécies Carollia perspicillata e Rhinophylla pumilio. Embora ambas as espécies possuam tamanhos semelhantes, forrageiem na região do subosque e sejam importantes dispersoras de sementes principalmente de espécies pioneiras, ao contrário de C. perspicillata, R. pumilio é mais rara nesses ambientes. Assim, o presente estudo teve como objetivo avaliar como a abundância dessas duas espécies de morcegos varia em função de variáveis em escala de paisagem (porcentagem de cobertura florestal e de cabruca, e quantidade de borda) e de variáveis locais (estrutura da floresta e quantidade de recursos) em áreas de cabrucas no Sul da Bahia. Os resultados do estudo sugerem que tanto C. perspicillata quanto R. pumilio, são afetadas positivamente pelo gênero Piper, e que ambas possuem preferência por áreas de remanescentes mais preservados e com menos borda. Sugerem também que C. perspicillata é menos afetada pelos atributos presentes nas áreas de amostragem, enquanto que R. pumilio é mais sensível à mudanças ambientais. Concluímos que as cabrucas possuem importância na atividade de Carollia perspicillata e Rhinophylla pumilio, porém não substituem os fragmentos florestais, sendo estes de extrema importância para a abundância das espécies de morcegos.

O branqueamento de corais consiste na diminuição populacional da zooxantela dentro do tecido coralíneo e está associado ao estado de depleção nutricional do coral, sendo considerado uma das principais causas de sua mortalidade. Existem duas vias bem elucidadas de branqueamento de corais, o Branqueamendo por Estresse Oxidativo e o Branqueamento por Infecção Bacteriana; entretanto, muitas evidências apontam uma correlação entre o branqueamento de corais e infecções virais. Diversos estudos indicam uma provável infecção viral latente em zooxantelas, onde partículas virais são expressas a partir da exposição das células algais à fatores estressantes relacionados ao branqueamento, como radiação UV intensa e altas temperaturas, levando à lise celular. Embora existam evidências de um possível papel das infecções por vírus gigantes no branqueamento de corais, ainda não existem explicações mecanicistas para vincular infecções virais ao estado de saúde dos corais. Neste trabalho, construímos um modelo matemático para investigar o provável comportamento da dinâmica populacional de zooxantelas a partir da influência da dinâmica infecciosa de vírus gigantes, onde este é capaz de estabelecer uma infecção latente no hospedeiro. A partir de um estudo extensivo dos valores de parâmetros relacionados ao processo de infecção e à estratégia reprodutiva dos vírus gigantes, encontramos que altas taxas de infecção lisogênica e transferência vertical da infecção viral estão relacionadas ao estado de coral saudável, enquanto que valores altos de indução viral estão relacionados ao estado branqueado. Além disso, sugerimos que a flutuabilidade anual de fatores ambientais podem levar ao aparecimento de ciclos de branqueamento. Sugerimos que essa dinâmica ímpar deve desempenhar um papel importante e anteriormente negligenciado nos eventos de branqueamento de corais. Propomos aqui uma nova hipótese para o branqueamento de corais – o  Branqueamento Viral de Corais – apontando quais são as condições teóricas em que essa via de branqueamento deve ser relevante.

Os comportamentos cooperativo e altruísta têm, por um longo tempo, intrigado biólogos no mundo todo devido ao seu aparente contrassenso evolutivo. Afinal, trata-se de um comportamento que gera um benefício a um outro organismo às custas do seu executor. Apesar de já ter sido investigado por muitos pesquisadores, pouca ênfase tem sido dada aos elementos biológico necessários à evolução de tais traços, e apenas recentemente tal questão foi trazida à luz da microbiologia ao considerar bactérias, fungos e protozoários, grupos de grande importância que desempenham papel relevante na saúde pública, economia e filosofia da ciência. Nos propomos a realizar uma revisão dos principais fatores biológicos que permitam a evolução e manutenção desse comportamento em microrganismos. A análise da literatura permitiu classificar os modelos em seis categorias principais: Condições ambientais; Expressão Genética Condicional; Privatização Parcial de Bens Públicos; Mecanismos de Imposição; Carona Cooperativa; e Tradeoffs de Crescimento e Dispersão. Muitos desses modelos acabam se imbricando com outros, e podem atuar conjuntamente no estabelecimento do comportamento cooperativo. Entre as premissas encontradas, a estruturação espacial entre organismos cooperadores e egoístas pareceu ser particularmente importante, visto que foi observada em diversos modelos diferentes. Essa pesquisa permitiu uma apreciação abrangente e bastante aprofundada do comportamento cooperativo e sua evolução em microrganismos, possibilitando novos estudos mais dirigidos que busquem elucidar de que formas esse comportamento se mantém em populações microbianas naturais.

A teoria de metacomunidade surgiu com o interesse em investigar como os processos locais e regionais interagem na estrutura da comunidade e a importância dos fatores ambientais e espaciais na determinação dessa estrutura. No entanto, este foco não tem sido abordado em regiões estuarinas tropicais para as comunidades fitoplanctônicas, formadas pelo principal grupo de produtores primários dos ecossistemas aquáticos. Sendo assim, o presente estudo teve como objetivo investigar como os filtros ambientais e preditores espaciais influenciam a estrutura da metacomunidade fitoplanctônica dos sistemas lóticos que desaguam na Baía de Camamu. Para tal, utilizamos duas abordagens complementares, uma baseada nos mecanismos através de análises de redundâncias parciais (pRDA) e outra baseada nos padrões com aplicação de um teste hierárquico denominado Elementos de Estrutura de Metacomunidades (EEM). As amostragens foram realizadas em abril e outubro de 2013, contemplando assim um período seco e um chuvoso. A distribuição dos dez pontos de coleta nos rios Maraú, Orojó e Serinhaém ocorreu ao longo do gradiente de salinidade, onde foram coletadas amostras qualitativas e quantitativas do fitoplâncton; amostras de água para análise de nutrientes: silicato, fosfato, nitrato, amônia e nitrogênio total; e foram medidos parâmetros físico-químicos: pH, oxigênio dissolvido (OD), salinidade, temperatura e sólidos totais dissolvidos (STD). As análises indicaram três padrões de metacomunidade: Gleasoniano, Clementsiano e Quase-aninhado, com mudança no padrão entre os períodos seco e chuvoso. Apenas o rio Maraú exibiu o padrão Gleasoniano nos dois períodos. Quanto aos mecanismos, houve predominância de variação total explicada pela influência compartilhada de preditores ambientais e espaciais. Dessa forma, podemos concluir que mudanças nos padrões de chuva podem interferir nas estruturas das comunidades fitoplanctônicas em ambientes estuarinos tropicais, porém tanto as variáveis espaciais quanto as ambientais serão importantes na estruturação dessas comunidades.

No primeiro capítulo desta tese apresentamos um arcabouço teórico que visa
contribuir com a solução de problemas de compatibilidade entre as hipóteses de efeito positivo da
heterogeneidade da paisagem e diversidade biológica com as hipóteses de perda e fragmentação de
habitat, propondo uma abordagem hierárquica para a construção de explicações mecanísticas, além da
incorporação da dimensão temporal de uma maneira mais explícita na estimativa da heterogeneidade da
paisagem. No segundo capítulo discutimos as implicações teóricas desse arcabouço para o estudo de
redes de interação ecológicas, mostrando como uma abordagem hierárquica e mecanística podem ajudar
a interpretar os efeitos das paisagens sobre as redes de interações descritos na literatura. No terceiro
capítulo apresentamos um estudo sobre a interação entre os efeitos da substituição da vegetação nativa
por áreas agrícolas e da heterogeneidade da paisagem sobre redes de interação planta-polinizador na
Chapada Diamantina-BA, onde as redes de interação apresentaram uma resposta positiva a proporção de
agricultura, mas em paisagens menos heterogêneas essa relação vem associada também a uma perda de
diversidade de polinizadores em relação a paisagens mais homogêneas. No quarto capítulo exploramos o
efeito da heterogeneidade da paisagem sobre a estabilidade no serviço de polinização e na formação de
frutos de café ao longo do tempo em cafezais da Chapada Diamantina – BA. Nesse capítulo mostramos
como paisagens mais heterogêneas favorecem um serviço de polinização mais estável ao longo do tempo
e como essa estabilidade promove maior produtividade média, com um incremento de 44% na formação
de frutos em um período de cinco anos. Concluímos a tese argumentando que a heterogeneidade da
paisagem é fundamental para a manutenção de comunidades mais diversas, com redes de interação
planta-polinizador mais complexas e com serviços de polinização mais estáveis o que promove maior
produtividade agrícola ao longo do tempo. Além disso, concluímos que existem evidências empíricas de
que podemos ampliar a aplicação do mesmo framework para além dos serviços de polinização, incluindo
serviços ecossistêmicos mediados pela biodiversidade de um modo geral.

Esta tese teve os objetivos de determinar as variáveis estruturantes da comunidade de diatomáceas bentônicas da baía de Camamu, modelar a relação de seus taxa com estas variáveis, determinar a dinâmica de transformações que as comunidades de diatomáceas sofreu no tempo por via da observação das diatomáceas preservadas em sedimento (semifósseis), avaliar desta forma se a região estuarina, previamente considerada pristina, já sofreu danos devido às atividades antrópicas na área, modelar a dinâmica das variáveis ambientais no tempo através de funções de transferência e propor a adaptação de técnica de mensuração de vulnerabilidade ambiental relativa também usando diatomáceas. Para tanto foram coletadas amostras de sedimento superficial em 30 pontos ao longo da baía e de seus tributários (rios Serinhaém, Orojó e Marau), coletados seis testemunhos e foram determinadas as concentrações dos nutrientes (séries nitrogenadas e fosfatadas e silicato) e das demais variáveis físico-químicas (temperatura, salinidade, pH, oxigênio dissolvido, potencial redox, matéria particulada em suspensão e granulometria). Foram observadas evidências que a baía está sofrendo um processo de eutrofização e que ela passou por um processo de progradação da zona costeira. Foram significativos os modelos para a distribuição espacial das variáveis salinidade, pH e condutividade, consideradas correlacionadas, e dos taxa Seminavis sp1, Fallacia nummularia (relacionado às estações de menor TDI), Paralia sulcata var. coronata e Thalassiosira sp1 (relacionadas à maior concentração de nutrientes, maior energia hidrodinâmica e às estações de maior TDI). Foram também significativos os modelos da relação entre a distribuição de Planothidium septentrionalis, oxigênio dissolvido e matéria particulada em suspensão (relacionado a ambiente praial), Delphineis sp1, salinidade e areia fina, Fallacia forcipata, areia grossa e matéria particulada em suspensão (relacionado à baixos valores de TDI) e entre Opephora olsenii e salinidade. Os resultados da função de transferência revelaram a tendência de redução da salinidade, reforçando a hipótese da progradação da zona costeira. A técnica de avaliação da vulnerabilidade relativa pôde ser adaptada com sucesso, indicando que os seus pontos mais a jusante no rio serinhaém e mais a montante no rio Marau são os mais vulneráveis devido à baixa profundidade.

Durante o Holoceno, que corresponde à época geológica pós glacial datada dos últimos 10 a 12 mil anos,
as atividades humanas se tornaram, gradualmente, em forças transformadoras dos processos naturais do
nosso planeta. As variações resultantes das atividades humanas conferem alterações no funcionamento dos
sistemas ecológicos principalmente ao provocar mudanças climáticas globais e perdas irreversíveis da
diversidade biológica. As mudanças climáticas naturais ou de origem antropogênica são a principal
ameaça para a aceleração da perda da biodiversidade marinha global pois afeta a dinâmica da população e
da comunidade e, a longo prazo, a estrutura e função da comunidade. Devido à dificuldade de se obter
registros ecológicos contínuos a longo prazo, as análises de maior abrangência temporal da história das
alterações ecológicas marinha ainda são escassas. Porém, através do registro da estrutura e composição das
assembleias de foraminíferos planctônicos fósseis é possível acessar as mudanças climáticas e respostas
ecológicas para além das últimas décadas.
Ainda não se conhece o estado da arte sobre publicações envolvendo esses organismos no Brasil, porém,

estudos prévios sugerem que há uma escassez de dados para o atlântico tropical leste, se comparado com a
costa sudeste do país. Nesse sentido, o Atlântico Tropical é responsável por importantes fenômenos
climáticos do Nordeste do país e apresenta grande potencial científico ainda pouco explorado. Assim, a
presente dissertação tem como principais objetivos: i. Realizar um levantamento cienciométrico de
publicações envolvendo foraminíferos no Brasil; ii. Analisar e descrever a fauna fóssil de foraminíferos
planctônicos na região oceânica adjacente à costa nordeste do país; iii. Inferir eventos paleoclimáticos e
paleoceanográficos a partir da paleoecologia desses organismos na mesma região. Para a cienciometria,
protocolou-se e realizou-se a recuperação de artigos publicados na plataforma científica Scopus. Para
análise e descrição das paleoassembléias foi coletado testemunho na área de estudo que datado apresentou
uma recuperação de aproximadamente 8 mil anos. O sedimento coletado foi fateado e em cada fração
foram triados 300 a 500 indivíduos. Esses organismos foram identificados a nível de espécie de acordo
com a literatura e artigos recentes. Para reconstrução paleoambiental utilizou-se Modelos Aditivos
Generalizados (MAGs) que propiciou inferências acerca das variações climáticas no passado geológico e
as principais respostas ecológicas. Nossos resultados principais registraram uma tendência crescente do
estudo desses organismos no Brasil ainda que, se comparado a outros países, esteja abaixo da média. Além
disso, registrou-se que a região sudeste é mais produtiva em estudos com esse grupo, e também contempla
as áreas mais estudadas. Descrevemos a nível de espécie, pela primeira vez, a fauna fóssil de foraminíferos
planctônicos no talude a 1900 metros de profundidade da região estudada, no qual 15 espécies foram
registradas pela primeira vez na região. Inferimos, a partir da ecologia das espécies, um aumento da
temperatura da superfície do mar de 8 mil anos até o presente, bem como um crescimento das condições
de oligotrofia. Por fim, o presente estudo contribui com a identificação da necessidade de ampliação dos
esforços em pesquisa que contemplem esses organismos, excepcionalmente nas regiões norte/nordeste do
país, bem como com a importância de maior atenção ao monitoramento de larga escala temporal, que
permita elucidações sobre a crise de biodiversidade marinha em vista das mudanças climáticas.

Dentre as principais consequências oriundas da atual época geológica, o Antropoceno, está a crise da biodiversidade, evidenciada por elevadas taxas de extinção de espécies e que tem sido o foco da Ciência da Conservação. Atualmente, além da biodiversidade, os bens e serviços provenientes da natureza passaram também a ser alvo de pesquisas em conservação. Frente às atuais pressões de conversão e fragmentação de áreas naturais, torna-se essencial compreender como se comportam espacialmente a distribuição de prioridades de biodiversidade e serviços afim de viabilizar a manutenção de ambos através da explicitação e conflitos e sinergias. Utilizando como caso de estudo o estado da Bahia, verificou-se como áreas prioritárias para conservação da biodiversidade de vertebrados terrestres, oriundos de bases de dados globais, no estado se relacionam as prioridades de conservação de remanescentes de vegetação natural, utilizados como proxie para serviços ecossistêmicos. Além disso, comparamos nossas priorizações com a proposta oficial de áreas prioritárias da Secretaria de Meio Ambiente do Estado da Bahia. Constatou-se que os cenários de priorização espacial alcançados com alvos de biodiversidade tiveram desempenho superior na proteção das espécies utilizadas no trabalho se comparado com os cenários de priorização de remanescentes de vegetação natural e a proposta oficial. As melhores áreas para uma expansão da atual rede de reservas obtidas com base nas maiores porcentagens de remanescentes na paisagem não apresentaram bons desempenhos com relação à proteção da biodiversidade, o que implica na possibilidade de estabelecer prioridades intercambiáveis entre estes dois atributos no contexto desse estudo. Além dos resultados com relação a definição de prioridades de conservação na Bahia, enfatizamos como os resultados obtidos a relevância e as possibilidades do uso de dados globais para guiar abordagens locais de conservação.

A pesca artesanal pode geralmente resultar na pesca fantasma e ameaçar os ambientes recifia, já que as linhas de pesca podem emaranhar, danificar ou até matar diversos organismos. Estruturas de recifes complexos, como os corais ramificados, estão entre os mais afligidos pela pesca fantasma devido à sua forma e a Millepora é o único gênero de hidrocoral ramificado nos recifes do Atlântico Sul, oferecendo vários recursos para muitas espécies de peixes recifais. Embora os impactos da pesca fantasma sejam bem conhecidos por afetar a indústria pesqueira e a megafauna, seus impactos nos principais organismos recifais, como corais ramificados e associações de peixes associados, permanecem praticamente desconhecidos. Nós hipotetizamos que as linhas de pesca perdidas e emaranhadas no hidrocoral ramificado M. alcicornis resultariam em um aumento da mortalidade enquanto reduziriam a abundância e a riqueza das de peixes de recifais associados. Além disso, investigamos se as linhas de pesca emaranhadas, resultando em simplificação estrutural, alterariam a freqüência dos comportamentos de refúgio, agonístico e de forrageio em diferentes espécies de peixes associados. Foram pesquisadas 30 colônias de M. alcicornis onde foi estimando seu volume, percentuais de ocupação das linhas de pesca nas colônias e a mortalidade. As colônias foram gravadas com vídeos para estimar a abundância total de peixes, a riqueza de espécies e quantificar o comportamento dos peixes. Nossos resultados demonstram altas porcentagens de mortalidade em hidrocorais com grandes quantidades de linhas de pesca emaranhadas. Além disso, encontramos uma diminuição significativa na frequência de tentativas de forrageio de duas espécies de peixes herbívoros associados (Acanthurus bahianus e Ophioblennius trinitatis) que desempenham um papel fundamental na dinâmica dos recifes de corais. A pesca fantasma resultante de pequena escala pode, portanto, ter impactos negativos em ecossistemas recifais rasos, particularmente em corais ramificados. Por sua vez, esses efeitos estruturais podem ser prejudiciais às interações entre peixes e corais. Testar as ramificações ecológicas e funcionais desses impactos em ecossistemas recifais rasos é um importante próximo passo.

A cobertura de corais nos recifes costeiros está em severo declínio nas últimas décadas pela interação de múltiplos estressores globais e antropogênicos com a mudança da dominância da cobertura bentônica para organismos não construtores da matriz recifal. Investigou-se o efeito da densidade populacional humana sobre a degradação da qualidade da água, atuando como fator determinante da cobertura de organismos não construtores. A composição da comunidade foi analisada por meio de fotoquadrados visuais, calculando a cobertura percentual dos grupos bentônicos. As variáveis ambientais referentes a qualidade da água foram registradas in situ (temperatura, turbidez, oxigênio dissolvido, pH e sólidos totais dissolvidos) e determinadas em laboratório (fosfato e nitrato). A estrutura da comunidade bentônica diferiu significativamente entre as classes de densidade populacional humana (inabitado, habitado e populoso). A maior cobertura média dos recifes analisados foi a de corais escleractíneos (28,01%±14,69), seguido por macroalgas (18,25%±5,41) e esponjas bioerodidoras (16,83%±10,62). A cobertura de organismos construtores (corais e algas calcarias) declinou progressivamente, de acordo com a densidade populacional humana, enquanto o grupo de não construtores aumentou. Registramos a dominância por macroalgas no recife da Pituba, zoantídeos no recife de Praia do Forte e esponjas bioerodidoras nos recifes de Guarajuba e Itacimirim. Em relação as variáveis abióticas houve uma diferenciação significativa entre as condições ambientais das regiões estudadas. Identificou-se que a densidade populacional exerce efeito sobre o processo de degradação da qualidade da água, influenciando na composição da comunidade bentônica. Os recifes dominados por algas e zoantídeos associaram-se com o aumento da disponibilidade de nutrientes e no teor de oxigênio dissolvido na coluna d’água. A dominância das esponjas bioerodidoras associou-se com a concentração de sólidos totais dissolvidos em Guarajuba e Itacimirim. Registrou-se um branqueamento das esponjas que se associou com elevadas temperaturas e altas concentrações de nitrato. Nossos resultados suportam a interferência da densidade populacional humana sobre a qualidade de água e a estrutura das comunidades bentônicas dos recifes costeiros. Enfatiza-se o papel do topo recifal na manutenção da resiliência dos recifes costeiros frente as ameaças locais e globais, perante a cobertura de organismos construtores. Reforçamos que inicianitas de manejo dos recifes costeiros devem estar baseados em programas de monitoramentos integrados em escala local da variabilidade da comunidade bentônica e das condições ambientais dos recifes costeiros.

A predação é um dos fatores que interferem na abundância e distribuição das espécies. Os organismos com maiores chances de sobrevivência são os capazes de conseguir escapar dos predadores. A camuflagem é um mecanismo antipredatório primário comum em gastrópodos marinhos. Neritina virginea é uma espécie de gastrópodo marinho abundante no litoral do brasileiro, caracterizada pela presença de variados padrões de coloração da concha. Este estudo visa verificar se os distintos padrões de coloração na concha desta espécie funcionam como um mecanismo de defesa frente à predação. Na região de Mangue Seco – BA, os dados foram coletados em quatro períodos amostrais distintos, entre os anos de 2013 e 2015, nos períodos secos e chuvosos. Foram coletados 2.530 indivíduos de Neritina virginea, e a maioria destes foi predada (com uma média de 75,68% de predação nos períodos de amostragem). Nos quatro períodos amostrais, a predação por peixes e aves teve maior porcentagem, com média de 58,69% de predação. A tabela de contingência indicou que não existe relação entre a adequabilidade da cor da concha dos indivíduos e a cor do substrato com a redução das chances de predação. Ao longo dos anos, quanto mais às presas especializam-se em se esconder dos predadores, estes especializam-se em encontrá-las. A população de N. virginea nos três períodos amostrais é composta em sua maioria por indivíduos juvenis, e no quarto período amostral por indivíduos adultos. O teste de Cochran Mantel-Haenszel indicou que os predadores não exibem preferência na escolha das suas presas com base na classe etária. Portanto, os diversos padrões de coloração da concha de N. virginea, na área estudada, não podem ser considerados como um mecanismo de defesa eficiente frente a predação.

As assembleias de poliquetas dos recifes de corais do litoral norte da Bahia (Brasil) foram estudadas durante quatro períodos visando analisar a variabilidade espacial e temporal na estrutura da comunidade, bem como a influência da resolução taxonômica na interpretação dos resultados. Dez quilos de substrato recifal foram amostrados de cada recife de coral, durante os anos de 2000, 2005, 2010 e 2016. Neste período 120 espécies foram registradas. Nos dois primeiros períodos amostrais, as famílias mais abundantes foram Eunicidae (55,8% e 60,14%, respectivamente), Nereididae (13,5% e 14,3%) e Syllidae (8,7% e 6%). No terceiro período, as famílias Eunicidae (61,1%) e Nereididae (19,3%) foram as mais abundantes e, por fim, em 2016 a família Eunicidae (92,5%) tornou-se dominante. A análise de cluster identificou três agrupamentos significativamente distintos, agregando os recifes de corais dos anos 2000 e 2005, sendo este cluster distinto dos outros dois, nos quais os recifes foram segregados de acordo com os dois últimos períodos amostrais. A dominância de espécies bioerodidoras, pertencentes a família Eunicidae, e a redução na abundância de silídeos, bem como a redução na diversidade caracterizaram o último período avaliado. Testou-se o uso da Suficiência Taxonômica nos resultados obtidos, realizando análises nos níveis de espécie, gênero e família. Os resultados indicam que, independentemente do nível taxonômico considerado, a estrutura das assembleias diferiu significativamente ao longo do período estudado. Demonstrou-se a adequabilidade do uso da resolução taxonômica no nível de gênero, quando a identificação a nível de espécie for inviável. Este estudo reforça a hipótese que os recifes do litoral norte do estado da Bahia vêm experienciando um estresse antrópico crônico, colocando os recifes em condições desfavoráveis favorecendo a atividade de bioerodidores.

O aumento da taxa de conversão de áreas naturais em áreas agrícolas, ocorrido nas últimas décadas, tem provocado um impacto negativo sobre a biodiversidade e os serviços ecossistêmicos. Em contrapartida, existem práticas que minimizam os efeitos da agricultura intensiva sobre a biodiversidade, como por exemplo a restauração florestal em áreas vizinhas aos cultivos. Dessa forma, buscamos no presente trabalho avaliar o efeito da restauração florestal sobre a provisão do serviço de polinização ao longo do tempo de implementação e em cultivos situados próximos e distantes das áreas restauradas. Testamos a hipótese de que em áreas restauradas próximas aos cultivos há maior estabilidade do serviço de polinização ao longo do tempo, medido pelo número de tubos polínicos formados nos estilos das flores do café e pela formação e qualidade dos frutos. O estudo foi realizado em fazendas de café situadas em um polo agrícola localizado entre os municípios de Mucugê e Ibicoara, na região da Chapada Diamantina, entre os anos de 2015 e 2018. As unidades amostrais foram selecionadas, dentre diversos critérios, pela proximidade as áreas restauradas. Os nossos resultados mostram que áreas restauradas próximas a cafezais contribuem para o aumento da deposição de pólen nos estigmas das plantas, destacando a importância não somente da implementação de áreas restauradas próximas aos cultivos, mas também do monitoramento a longo prazo do efeito dessas áreas sobre o serviço de polinização de culturas. As análises dos dados aqui apresentados não mostram diferença estatística significativa para a proporção de frutos formados, nem para peso e quantidade de sementes desses frutos, indicando que as variáveis preditoras utilizadas podem estar sofrendo influência de outros fatores. Portanto, sugerimos estudos complementares que avaliem outros fatores relacionados ao estabelecimento da restauração, como o tempo mínimo para que áreas restauradas forneçam recursos aos polinizadores e contribuam de fato para que esses animais permaneçam na paisagem agrícola, assim como estudos que avaliem sinergias e trade-offs entre a implementação da restauração florestal e a manutenção de polinizadores em diferentes contextos da paisagem.

A broca-do-café (Coleoptera: Scolytidae: Hypothenemus hampei) é considerada como a praga que causa maior prejuízo à produção do café no mundo. Por muito tempo o inseticida Endosulfan  foi utilizado para combater essa praga, mas devido aos efeitos deletérios desse agente químico sobre a saúde humana, ao meio ambiente e à biodiversidade, muitos países decidiram banir o uso dessa substância.  Dessa maneira, o inseticida biológico baseado em esporos do fungo entomopatogênico Beauveria bassiana (Balsamo) Vuillemin tornou-se uma das principais medidas no manejo integrado de pragas do café. Porém, a liberação desse microrganismo através da pulverização requer altas concentrações de esporos, aumentando assim o custo da sua utilização. Uma alternativa eficaz para a aplicação/dispersão desses microrganismos contra pragas agrícolas é a utilização de polinizadores como vetores.  Sabe-se que a abelha A. mellifera é  considerada um importante polinizador da espécie C. arabica  e o fungo B. bassiana é um dos principais organismos utilizados para o controle da broca-do-café. A escassez de estudos que  avaliam o efeito das interações entre  A. mellifera e o fungo B. bassiana dificulta a utilização do entomovetor no controle biológico de pragas. O presente trabalho tem como  objetivos: 1) Discutir sobre o ponto de vista teórico e de maneira não-sistemática, como o controle biológico aliado à polinização podem ser utilizados  como parte do manejo da broca-do-café  e 2) avaliar o impacto do isolado fúngico PL63 de B. bassiana sobre o  desenvolvimento e mortalidade das colônias  de A. mellifera em condições de campo.  Para o ensaio com as colônias em campo, o inóculo foi prepado através da mistura do fungo com o inerte Vectorite à concentração 1 x 10⁸ esporos/g.  O grupo controle foi tratado apenas com Vectorite. Foram realizados dois ensaios: 1) mortalidade de abelhas nas colmeias e 2) avaliação do tamanho da área de cria. Não foram encontradas diferenças significativas no número de abelhas mortas coletadas entre o tratamento e o controle, nem a interação com os dias de coleta. A variação do tamanho da área de cria não foi estatisticamente significativa entre o tratamento e o controle.  O tamanho da área de cria operculada das colônias controle e tratadas reduziu drasticamente ao longo das cinco avaliações, 0-19 dias, impedindo a tomada de decisão sobre os possíveis efeitos do fungo B. bassiana sobre a cria operculada. Porém, os dados de mortalidade de abelhas adultas do presente estudo demostram o agente de controle microbiano B. bassiana não causa a mortalidade de A. mellifera em condições de campo.

As invasões biológicas ocorrem quando espécies são introduzidas em uma área onde elas não ocorriam naturalmente, como consequência de atividades antrópicas. Espécies são definidas como invasoras quando elas, após serem introduzidas, causam impactos ecológicos, econômicos e/ou sociais. Os impactos ecológicos podem ocorrer quando as espécies invasoras alteram processos biológicos que influenciam as funções do ecossistema. O objetivo da presente tese é avaliar efeitos de espécies invasoras sobre os processos ecológicos de ecossistemas recifais. Dois casos de invasões foram estudados, o coral-sol Tubastraea tagusensis e T. coccinea nos recifes de corais do Brasil e a alga-verde Caulerpa filiformis nos recifes rochosos da Austrália. No caso do coral-sol foram feitos experimentos de campo para avaliar os efeitos da abundância desse invasor sobre o processo de recrutamento de corais e sobre a interação peixe-bentos. No caso da alga-verde foram feitos experimentos no laboratório (mesocosmo) para avaliar o efeito interativo da presença da alga-verde com aquecimento da água sobre o processo de herbivoria do gastrópode Turbo militaris sobre as algas-marrons Ecklonia radiata e Sargassum vestitum. Os resultados revelaram que, em ambos os casos, a presença das espécies invasoras influenciaram os processos biológicos estudados. Os experimentos usando o coral-sol mostraram que, a alta abundância encontrada no recife estudado foi relacionada com a redução do número de recrutas de corais nativos assim como a cobertura dos adultos, o que sugere que a invasão pode alterar o processo de recrutamento dos corais nativos. Além disso, os resultados mostraram que a abundância do coral-sol reduziu o número de mordidas de peixes nativos sobre as espécies de algas, corais e esponjas nativas. Assim, o coral-sol alterou a intensidade de alimentação dos peixes nativos sobre o substrato, o que pode ter implicações para importantes funções do ecossistema como a bioerosão do substrato, o controle de algas e o transporte de sedimentos. No caso da alga-verde, os experimentos de laboratório mostraram que sua presença em condições de aquecimento da água (26°C) reduziu a intensidade e a preferência alimentar do gastrópode sobre a alga-marrom nativa Ecklonia radiata. O aquecimento da água intensificou o consumo das algas nativas pelos caracóis que tem seu metabolismo acelerado sob essas condições. Contudo quando a alga-verde invasora esteve presente mesmo sob essas condições de elevada temperatura, a atividade de alimentação sobre a alga nativa foi menor do que sem a alga-verde. Assim a presença da alga-verde invasora poderia potencialmente aumentar a sobrevivência da alga nativa (E. radiata) em cenários de mudanças climáticas. Assim, foi possível concluir que espécies invasoras podem alterar processos ecológicos nos ecossistemas marinhos, como o ciclo de vida de espécies chave e interações entre espécies nativas como a herbivoria, mas em cenários de mudanças climáticas os efeitos podem ser distintos. Dessa forma, entender como ocorrem as relações entre as espécies é essencial para avaliar o funcionamento dos processos, e para prever e manejar os ecossistemas invadidos em cenários futuros.

Entender os fenômenos responsáveis pela formação e manutenção da biodiversidade de organismos tem sido o objetivo de numerosos estudos em ecologia e biogeografia. O reconhecimento dos padrões de diversidade, assim como a compreensão dos processos e fatores que os produzem e afetam a biodiversidade são fundamentais para estabelecer os princípios de manejo, recuperação e uso sustentável de áreas naturais. A busca por compreender as implicações das mudanças na biodiversidade sobre o ecossistema tem demonstrado que tanto variações na diversidade taxonômica quanto na diversidade funcional podem acarretar em alterações ambientais. As Florestas Tropicas compreendem alguns dos ambientes terrestres mais biodiversos do planeta. A Mata Atlântica brasileira é um dos 35 hotspots de biodiversidade da Terra, que correspondem a regiões com altas taxas de biodiversidade e de endemismo, que são altamente ameaçados pelas atividades humanas. Invertebrados são grande importância nos processos ecológicos que ocorrem nos ecossistemas terrestres. Entre esses, as formigas compreendem um dos grupos de organismos mais abundantes e diversos. Esses organismos exercem um importante papel na dinâmica ambiental, fornecem diversos serviços ecossistêmicos e são consideradas bioindicadoras confiáveis. Tais características fazem das formigas uma ferramenta útil para o monitoramento dos ecossistemas. O objetivo principal dessa tese foi estudar diferentes padrões e processos responsáveis pelas diversidades taxonômica e funcional, bem como as variações dessas, em assembleias de formigas de serapilheira no domínio da Mata Atlântica. A área de estudo compreendeu 65 paisagens de Floresta Atlântica, distribuídos em aproximadamente uma área de 130 x 50 km e abrangendo 26 municípios no sul do estado da Bahia, Brasil. Em cada localidade, as formigas foram coletadas em 50 amostras de 1m² de serapilheira, com o auxílio de extratores de Winkler. No primeiro capítulo, foi estudada a diversidade de formigas de serapilheira dessa região e foi avaliado se a diversidade taxonômica apresenta uma correspondência com a diversidade funcional dessas formigas. Foi registrado um total de 364 espécies, distribuídas em 68 gêneros e 10 subfamílias. Essas foram atribuídas a 13 grupos funcionais quando se considera uma classificação baseada no conhecimento disponível sobre os gêneros de formigas e a 26 grupos funcionais quando se considera uma classificação baseada em informações disponíveis sobre as espécies. Foi observado que a diversidade taxonômica não apresenta uma correspondência clara com a diversidade funcional de formigas de serapilheira, embora tal relação sofra uma influência da abrangência da classificação funcional utilizada. No segundo capítulo, foi avaliado se as comunidades de formigas da serapilheira apresentam um padrão saturado ou não saturado, e se a resposta difere de acordo com a abordagem. Foi verificado que as comunidades de formigas de serapilheira apresentam um padrão não saturado nas diferentes localidades estudadas, independente da métrica e método utilizados. No terceiro capítulo da tese, foram feitas avaliações e comparações do uso de categorias de resolução taxonômica de diferentes níveis como possíveis substitutos para descrever padrões de diversidade taxonômica e funcional de assembleias de formigas da serapilheira. Foi demonstrado que uma resolução mista, envolvendo a identificação de um número limitado de espécies enquanto a grande maioria do material biológico permanece identificado somente ao nível de gênero, é o melhor substituto quando se considera tanto a diversidade taxonômica quando funcional. Tais resultados podem ser de grande utilidade para estudos de bioindicação e monitoramento ambiental. No quarto capítudo revisamos a importância do termo guilda para a ecologia, avaliamos o uso indevido do termo e discutimos a importância de homogeneizar os diferentes termos conotativos e definir de maneira clara as diferentes guildas utilizadas a fim de se obter uma linguagem que nos permita entender o alcance do termo sem ambiguidade. Finalmente, nossos resultados sugerem que diferentes padrões e processos ecológicos e biogeográficos contribuem para as diversidades taxonômica e funcional e as variações observadas nessas em assembleias de formigas de serapilheira no domínio da Mata Atlântica no sul da Bahia, Brasil. Acreditamos, entretanto, que futuros estudos considerando algumas variáveis não avaliadas aqui, como cobertura florestal, complexidade estrutural, bem como outras métricas de paisagempara elucidar o real efeito de dessas, serão de suma importância para entender como diferentes variáveis podem influenciar o número de espécies e processos ecológicos envolvendo as assembleias de formigas de serapilheira na Floresta Atlântica.

A presente tese de doutorado teve o objetivo de construir uma narrativa em história das ciências ecológicas com foco na trajetória intelectual do ecólogo norte-americano Robert Treat Paine (1933-2016) e no desenvolvimento de uma tradição de pesquisa experimental em praias rochosas, que foi liderada por ele entre as décadas de 1960 e 1980. Paine se destacou na ecologia como cientista experimental e criador do conceito de espécies-chave. Ele ainda desenvolveu o conceito de cascata trófica e a hipótese de que a predação exerce um grande efeito positivo sobre a diversidade de espécies. Esses e outros avanços conceituais, teóricos e metodológicos promovidos por Paine se deram através da realização dos seus experimentos clássicos de manipulação de espécies. Os estudos historiográficos de livros, artigos, cartas e entrevistas, dentre outros materiais, evidenciaram as linhas de pesquisa geradas pelos experimentos de campo e a influência deles na ecologia de comunidades e de teias tróficas. Este trabalho é constituído de dois capítulos em formato de artigos. O primeiro aborda o nascimento da tradição de pesquisa experimental em praias rochosas, examinando como Paine e outros pesquisadores lidaram com a variabilidade das condições ambientais do campo e tentaram estabilizar seus resultados. O segundo capítulo examina as principais contribuições de Paine para a ecologia de teia alimentar, um dos campos científicos em que ele mais colaborou.

Estudos sobre os padrões de distribuição das espécies e os mecanismos responsáveis por tais padrões na Floresta Atlântica são importantes para conhecer a história biogeográfica do bioma e determinar áreas para a conservação. Os opiliões são importantes para estudos biogrográficos e ecológicos, pois apresentam baixa capacidade de dispersão e são sensíveis à alterações ambientais. Contudo, poucos são os estudos que avaliam a distribuição desses organismos em gradientes ambientais. Nós investigamos a distribuição espacial dos opiliões em um gradiente latitudinal de Floresta Atlântica e os fatores históricos e ecológicos que podem explicar tais padrões. Para fins de inclusão de opiliões em programas de monitoramento, analisamos a utilização de cinco resoluções taxonômicas (gênero, família, subfamília, taxa indicadores e resolução intermediária) como substitutas da riqueza e composição de opiliões no gradiente estudado. Os estudo foi conduzido em 19 localidades de Floresta Atlântica distribuídas nos Estados da Paraíba, Pernambuco, Alagoas, Sergipe e Bahia. Os opiliões foram coletados através de duas técnicas de amostragem: coleta manual noturna e amostra de serrapilheira. Foram coletados 3.566 indivíduos distribuídos em 7 famílias, 26 gêneros e 88 espécies. A análise de cluster separou a assembléia em dois principais agrupamentos: “Pernambuco” e “ Bahia”. A composição de espécies apresentou estruturação espacial correlacionada com a distância geográfica (R² = 67.7 ; p<0.001) e foram encontradas diferenças composicionais entre o núcleo de congruência e a região máxima de endemismo da AE “Bahia” (F= 3.2; p < 0,001). As variáveis ambientais mais correlacionadas com o gradiente amostrado foram: latitude, altitude, cobertura da vegetação na paisagem e temperatura média do trimestre mais quente. Entretanto, os dois eixos do CCA explicaram pouco da variação encontrada (27.6%). A proporção do componente turnover (βSIM = 0.8804) foi maior do que o componente aninhamento (βSNE=0.0572). Gênero (R² =0.933; p < 0.001) e resolução intermediária (R² = 0.939; p<0.001) foram classificadas como excelentes substitutos para a riqueza de opiliões. Em relação SECRETARIA DAS PÓS-GRADUAÇÕES NÚCLEO DE APOIO TÉCNICO-EDUCACIONAL INSTITUTO DE BIOLOGIA – UNIVERSIDADE FEDERAL DA BAHIA Rua Barão de Geremoabo, s/n. Ondina – Salvador – Bahia – CEP. 40.170-000 Telefone: (71)3283-6519 à composição de espécies, resolução intermediária (média = 0,995; desvio padrão = 0,10), gênero (0,935±0,122), taxa indicadores (0,904±0,141) e subfamília (0,808±0,162) foram considerados excelentes substitutos. A baixa explicação das variáveis ambientais sobre a distribuição das espécies de opiliões, juntamente com a separação norte-sul da assembléia de opiliões no gradiente estudado e o elevado turnover observado, sugerem que fatores históricos (aparecimento de barreiras geográficas e refúgios pleistocêncios), assim como, mudanças na fitofisionomia do bioma ao longo do gradiente influenciaram a distribuição dos opiliões. As mudanças composicionais observadas ao longo do gradiente, com diversas localidades apresentando uma fauna característica, indicam a necessidade de planos de conservação que envolvam o maior número possível de reservas, garantindo a conservação de uma maior riqueza de opiliões. Indicamos, para fins de rápidos inventários e monitoramento da biodiversidade, a utilização de gênero e resolução intermediária como substitutos adequados de riqueza e composição de opiliões na Floresta Atlântica

A Avaliação de Impacto Ambiental (AIA) é o instrumento de política pública ambiental mais disseminado a nível global. Há expectativa de que a AIA promova uma avaliação integrada dos impactos sobre os ambientes físico, biológico e social, demandando a integração de conhecimentos de diferentes disciplinas acadêmicas e setores sociais. Acreditamos que a crítica de que este instrumento não tem sido capaz de propiciar essa integração pode derivar da falta de integração na produção acadêmica sobre AIA e, tendo em vista a sua abrangência e relevância, consideramos que este pode fornecer indícios importantes sobre a produção de conhecimento científico aplicado e útil à gestão ambiental pública. Na primeira parte da tese avaliamos essa hipótese, caracterizando a literatura científica recente sobre AIA, considerando o padrão de autoria e o padrão de citação dos artigos selecionados. Os resultados revelaram: (a) grande disparidade entre as áreas de conhecimento na produção científica aplicada à AIA, no Brasil e no mundo, com predomínio de pesquisadores das engenharias (Brasil: 92,5%; Mundo: 65%), e participação reduzida da ecologia (Brasil: 27,5%; Mundo: 15%) e das ciências sociais e humanas (Brasil: 27,5%; Mundo: 10%); (b) os artigos de periódicos das engenharias são os mais citados (Brasil: 42%; Mundo: 37%), e os da ecologia (Brasil: 9,7%; Mundo: 8,9%) e ciências sociais e humanas (Brasil: 9,4%; Mundo: 12%) são os menos citados em todos padrões de produção de conhecimento. Os resultados sugerem que o campo de pesquisa de AIA no Brasil está se estabelecendo com pouca participação da ecologia e das ciências sociais e humanas. Acreditamos que, se estas ciências desejam ampliar sua relevância na atual crise ambiental devem incluir em sua agenda a interação com outras disciplinas e o setor não acadêmico, visando produzir conhecimento útil à gestão ambiental pública. Na segunda parte da tese propomos um modelo hierárquico desenvolvido a partir da revisão e sistematização da literatura de campos de pesquisa diversos e entrevistas com cientistas, estudantes de doutorado e técnicos de órgãos ambientais das áreas das engenharias, ecologia e ciências sociais, para explicar os fatores que estimulam a produção de conhecimento científico aplicado e útil à gestão ambiental pública. A análise das literaturas e das entrevistas propiciou uma riqueza de perspectivas e uma compreensão mais ampla sobre os fatores que influenciam a lacuna ciência-prática na gestão ambiental pública, além da identificação de concepções compartilhadas e particulares às áreas de conhecimento. Esperamos que nosso modelo estimule outros pesquisadores a aperfeiçoá-lo conceitualmente.

A humanidade vem enfrentando diversos problemas advindos da degradação ambiental e como parte de tentativa de se combater essa degradação e suas consequências, cientistas e economistas ambientais iniciaram uma abordagem antropocêntrica para a conservação ambiental. Um dos expoentes dessa abordagem são os serviços ecossistêmicos (SE), que tem ganhado bastante relevância e se tornado uma peça central em tratados e programas internacionais para a conservação do meio ambiente e da biodiversidade (CBD, IPBES). A abordagem dos SE tem seus méritos, mas também tem seus problemas e uma das dificuldades encontradas no uso dos SE é entender a relação que existe entre as funções e os serviços dos ecossistemas e a biodiversidade. Essa relação tem sido estudada de diversas formas, porém tais estudos, por influência do antropocentrismo que caracteriza os SE, tem sido enviesado podendo deixar de lado aspectos ecológicos importantes. O objetivo dessa dissertação foi avaliar, através de uma revisão de literatura, como podem acontecer as relações entre os serviços e funções ecossistêmicas, a partir de uma perspectiva ecocêntrica. Da avaliação das relações entre serviços e funções ecossistêmicas foi encontrado que: o conceito dos SE baseado na busca de benefícios causa uma possível negligência de importantes funções que ocorrem num ecossistema, mas não são de interesse humano e também ignora o fato de que as funções ecossistêmicas podem ter relações negativas com os SE, levando a uma possível deterioração das interações que acontecem entre as diversas espécies, afetando o funcionamento dos ecossistemas e o fornecimento de serviços. Para ambos os casos a biodiversidade pode ser de grande valia, funcionando como uma espécie de garantia contra consequências imprevisíveis da abordagem dos SE.

O modelo da Teoria de Biogeografia de Ilhas (TBI) propõe que a riqueza de espécies nas ilhas é determinada pelos processos de imigração e extinção, e controlados pelo grau de isolamento e tamanho das ilhas, respectivamente. A TBI têm favorecido estudos empíricos com diversos grupos taxonômicos e tipos de ilhas, demostrando o papel das características fisiográficas na diversidade insular. O Modelo Dinâmico Geral (MDG) incorpora os estágios de desenvolvimento das ilhas vulcânicas para explicar a diversidade de espécies nesses ambientes, produzindo um padrão unimodal da diversidade ao longo do tempo. Porém, as ilhas continentais surgem principalemtne das flutuações do nível do mar parecem responder diferente do que as ilhas vulcânicas devido os processos de relaxamento. Aqui, nós testamos como a área (km2), o isolamento geográfico (km) e a idade das ilhas desde o Último Glacial Máximo (UGM) determinam a riqueza de vertebrados terrestres nas ilhas de plataforma continental do Brasil. Nós acessamos informações de ocorrência de anfíbios, répteis e aves em 67 ilhas > 0.1 km2. Estimamos a idade das ilhas desde o seu isolamento nos últimos 21.000 anos ajustando a variação do nível do mar a um modelo espacial altimétrico da área de estudo. Nós aplicamos a seleção de modelos baseada no Critério de Informação de Akaike - AICc, usando sete diferentes modelos que explicam o padrão de riqueza das ilhas e incluímos a estrutura espacial aos modelos para resolver o problema da autocorrelação presente nos resíduos dos modelos. Investigamos também a relação espécie-área (ISAR) avaliando os parâmetros de intercepto (logC) e inclinação (z-valor) da reta para cada grupo taxonômico. As ilhas da plataforma continental brasileira foram isoladas do continente entre 13.700-7.400 anos atrás. A autocorrelação espacial influenciou a escolha dos modelos, mas não alterou a ordem da importância relativa das variáveis preditoras. O tamanho das ilhas influenciou positivamente a riqueza de espécies nas ilhas explicando 34-66% da variância no conjunto de dados. A área esteve presente em todos os modelos parcimoniosos, sendo a variável preditora mais importante definindo o padrão de riqueza dos vertebrados. O z-valor foi maior que o comumente observado na literatura e não observamos diferenças na capacidade de dispersão entre os grupos taxonômicos (z-valor = 0.383 ± 0.055 - 0.43 ± 0.064). O logC oscilou entre os voadores (logC = 0.936 ± 0.073) e não voadores (logC = 0.359 ± 0.081). O valor maior para os voadores pode representar o efeito da maior habilidade das espécies em dispersar sobre água aumentando o efeito resgaste. O isolamento geográfico e o tempo de isolamento afetaram os não-voadores, reduzindo o número de espécies nas ilhas. O isolamento geográfico foi responsável por reduzir as taxas de imigração nos não-voadores, reduzindo por consequencia número de espécies nas ilhas. A riqueza de espécies nas ilhas da plataforma continental brasileira é determinada principalmente pelos processos de extinção que são responsáveis por reduzir a riqueza de espécies em ilhas supersaturadas. Além disso, as espécies não-voadoras são esperadas por serem mais afetadas que as espécies voadoras.

Os riscos que as hidrelétricas representam são subestimados para as florestas tropicais
em todo o mundo. É tido que as hidrelétricas desmatam além dos limites de sua
instalação, mas a extensão desses impactos é incerta e, portanto, negligenciada no
licenciamento ambiental. Em 2024 estima-se que o Brasil consumirá 790,4 TWh no
ano, 66% a mais que o consumo em 2015, cujo consumo foi de 524,6TWh. Para
satisfazer tal demanda, a opção preferencial adotada tem sido expandir a principal forma
de produção de energia no país: as hidrelétricas. A Amazônia Legal é a nova fronteira de
expansão da exploração dessa fonte. Aqui quantificamos o desmatamento induzido
pelas hidrelétricas e investigamos os aspectos que a longo prazo podem contribuir para
este impacto. Utilizando zonas com raios de 10 a 100km de distância das hidrelétricas,
comparamos a área desmatada com outras regiões semelhantes sem influência das
barragens, escolhidas por um escore de propensão por pareamento, usando como
parâmetros: distância de rodovias e rios, agricultura, declividade e áreas protegidas. Nos
nossos resultados não houve diferença no desmatamento entre as áreas próximas às
hidrelétricas e seus controles, o que pode indicar que as hidrelétricas não influenciam a
perda florestal da Amazônia, entre 2005 e 2015. As hidrelétricas têm sido alvos de
muitas críticas pondo em cheque a sua característica enquanto produtor de energia
renovável, visto a liberação de gases de efeito estufa (Fearnside, 2004), bem como os
impactos na biodiversidade de vertebrados tanto aquáticos como terrestres (Benchimol
& Peres, 2015; Lees et al. 2016). Entretanto, concluímos que as hidrelétricas não podem
ser consideradas vetores importantes no desmatamento do seu entorno.

Atualmente os recifes de corais se encontram ameaçados por impactos locais e globais sendo o aumento do aporte de sedimento e o aquecimento dos oceanos dois dos principais estressores. Até mesmo os recifes de corais do Atlântico Sul, expostos naturalmente a um aporte elevado de sedimento, estão hoje ameaçados pelo aumento da turbidez e da sedimentação em consequência de ações antrópicas destrutivas. Frequentemente o alto aporte de sedimento implica em baixa diversidade, baixos níveis de recrutamento, altas taxas de mortalidade e baixos valores de cobertura coralínea, com comunidades dominadas por espécies de corais tolerantes ou por organismos competidores e não-construtores. Simultaneamente o aquecimento global dos oceanos provoca o fenômeno de branqueamento dos corais, definido como a perda dos dinoflagelados simbiontes (zooxantelas) ou de seus pigmentos, implicando em redução da fotossíntese. É crescente a preocupação científica em relação aos efeitos de estressores múltiplos sobre a vitalidade dos recifes de corais. A ideia comumente aceita é que os impactos locais provocam a perda de resistência/resiliência dos recifes frente aos impactos globais. Entretanto esse tipo de estudo ainda é raro, especialmente os que utilizam ecossistemas recifais marginalmente turvos como modelo de estudo. Neste contexto aqui foi destacado o papel do aporte de sedimento na estruturação das assembleias de corais. Ainda, a partir de experimentação ‘ex situ’, foi comprovado que a elevação do aporte de sedimento e da temperatura da água atuam de maneira sinergética, amplificando os danos sobre o metabolismo dos corais. Mais especificamente observou-se que no maior complexo de recifes do Atlântico Sul, os ecossistemas próximos da costa e expostos a intensa turbidez apresentam maiores valores de cobertura além de maior abundância e diâmetro colônias em relação aos recifes afastados. Esse padrão incomum reflete o melhor desempenho nos recifes mais turvos de cinco espécies de corais, aparentemente tolerante ao aporte de sedimento e que sustentam comunidades de corais robustas. Diferentemente nos recifes afastados da costa, observou-se o domínio de Mussismilia braziliensis, um coral endêmico aparentemente não tão tolerante ao aporte de sedimento, mas que se comporta como um forte competidor em condições ambientais mais amenas. Além de destacar o aporte de sedimento e a elevação da temperatura como dois importantes estressores local e global, respectivamente, foi constatado que ambos interagem sinergisticamente amplificando os danos causados sobre o metabolismo fotossintético e respiratório do hidrocoral Millepora alcicornis, um construtor chave e bastante abundante dos recifes do Atlântico Sul. Os resultados aqui apresentados oferecem subsídios valiosos no esforço de conservação dos ecossistemas recifais, ‘hotspots’ da biodiversidade, considerando o cenário atual dos mares cada dia mais quentes e poluídos.

As atividades antrópicas desenvolvidas nos ambientes marinhos são as maiores fontes de hidrocarbonetos policíclicos aromáticos (HPAs). Esta classe de compostos orgânicos faz parte da composição química do petróleo, e possui especial atenção devido ao seus efeitos tóxicos e mutagênicos sobre a fauna marinha. Diferentes tipos de eventos envolvendo HPAs têm resultado na exposição pontual (e.g. incidentes com embarcações) ou prolongada (e.g. resíduos de indústrias petroquímicas) sobre os ambientes estuarinos, resultando em cenários de contaminação de grande persistência sobre as assembleias bentônicas. As avaliações sobre os efeitos dos HPAs têm sido baseadas na abordagem taxonômica. No entanto, essa abordagem é inadequada para investigar as consequências ecológicas sobre a estrutura funcional da fauna. A abordagem indicada é a Análise dos Traços Biológicos, a qual reúne informações sobre as características morfológicas e ecológicas das espécies presentes nas assembleias, indicando os aspectos da sua ecologia funcional. Nesse contexto, a partir de uma abordagem mensurativa, a presente tese investigou a influência de uma grande indústria petroquímica situada no entorno da Baía de Todos os Santos (Salvador, Bahia) sobre a estrutura taxonômica e funcional de nematodas e da macrofauna. Baseado na análise de particionamento da variância foi testado que as concentrações de HPAs e/ou a proximidade espacial com a refinaria explicaria parte da variabilidade encontrada. Também foi avaliado, a partir de uma abordagem experimental in situ, os efeitos de curto prazo de um derrame de óleo diesel entre assembleias de nematodas e macrobentos próximas e distantes à refinaria. A hipótese testada foi que assembleias expostas as perturbações por óleo por décadas exibiriam uma maior resistência comparadas as assembleias não expostas. Neste experimento, um delineamento MBACI (multivariate before and after/control and impact design) foi conduzido onde tratamentos expostos ao óleo foram comparados com os controles, dois tempos antes e dois tempos após o derrame. A abordagem mensurativa desenvolvida, mostrou que uma grande fração da variação funcional e taxonômica das assembleias foram explicadas pela interação entre local (i.e., proximidade com a refinaria de óleo) e características do sedimento. O mesmo foi observado para a interação relativamente baixa, porém significativa, observadas para as concentrações de HPAs e as características do sedimento. As assembleias de nematodas mostraram serem mais sensíveis às concentrações de HPAs, proximidade com a refinaria de óleo e com as características do sedimento. Além disso, as espécies de nematodas permitiram maiores inferências mecanisticas em relação a analise funcional, i.e., se um padrão particular é uma resposta impulsionada pelas variáveis ambientais e/ou um efeito das perturbações geradas pelas atividades da refinaria. Em relação a abordagem experimental, as assembleias macrobentônicas foram resistentes ao derrame de óleo, expressa pela ausência de variações significativas na estrutura taxonômica e funcional, independente do histórico de perturbação. Diferenças significativas foram observadas sobre as assembleias de nematodas, especificamente em uma das áreas sem histórico de exposição por HPAs. Nesta área, a fauna apresentou uma queda na densidade geral após o derrame experimental e não se recuperou até o final do experimento (em torno de cinco dias depois). Considerando as escalas temporais e espaciais usadas, o efeito do óleo não causou variações significativas na composição dos traços funcionais. Outros experimentos devem ser desenvolvidos para investigar quais as escalas apropriadas e quais as combinações de traços podem ser afetadas por eventos de derrame de óleo.

A relação entre predadores e presas é um importante processo ecológico que regula o fluxo de energia e matéria de diversas teias alimentares, sendo proposto como um dos principais mecanismos reguladores da composição e da estrutura de assembleias biológicas em nível local.  Em recifes de corais do Caribe, recentes evidências mostraram que o controle de topo por peixes recifais (e.g. Pomacanthus arcuatus, Pomacanthus paru e Holacanthus ciliaris) regula assembleias de esponjas. Além disso, a predação pode evitar a exclusão competitiva de competidores superiores pelo controle de suas abundâncias no substrato que é recurso limitado para as espécies bentônicas recifais. As esponjas são consideradas um grupo competidor superior na aquisição de espaço, devido a reconhecidas estratégias de defesa (física e química), se comparadas aos corais hermatípicos (construtores de recife). Dessa forma, as esponjas podem afetar o processo de recrutamento e crescimento de corais, comprometendo importantes processos ecológicos. Alternativamente, impactos negativos da competição de esponjas sobre corais têm sido atenuados por efeitos indiretos da predação por peixes sobre as esponjas em recifes de corais de alta diversidade. Entretanto, essas relações não têm sido avaliadas no Atlântico Sul, importante região com alto endemismo e baixa diversidade relativa. Assim, o presente estudo investigou a influencia de peixes predadores sobre a estrutura das assembleias de esponjas de recifes de corais na Baía de Todos os santos, Bahia, Brasil. Foi investigada se existe uma relação negativa entre a cobertura de esponjas e a densidade de peixes espongívoros. Adicionalmente, foi avaliada a atividade de forrageio para investigar se existe seleção de esponjas por peixes espongívoros e para acessar o efeito da espongivoria sobre interações competitivas entre esponjas e corais hermatípicos. Os resultados do estudo mostraram que peixes predadores não controlam as assembleias de esponjas nos recifes de corais estudados. Entretanto, houve uma relação significativa entre a cobertura de Scopalina ruetzleri e a densidade de Pomacanthus arcuatus, sugerindo que o controle predador-presa pode ocorrer ao nível de espécie, mas não ao nível de assembleia. Os espongívoros selecionaram Desmapsamma anchorata, Scopalina ruetzleri, Aplysina cauliformis eNiphates erecta, espécies de esponjas que são consideradas na literatura como palatáveis ou não toleradas pelos predadores. Além disso, o aumento da densidade de peixes espongívoros não refletiu na diminuição do número de encontros naturais entre esponjas e corais hermatípicos. Assim, sugerimos que o efeito da predação por peixes sobre as interações com corais hermatípicos e sobre a cobertura de esponjas pode ser considerada fraco nos recifes de corais do Atlântico Sul. Possivelmente, a combinação de fatores naturais (e.g. sedimentação) e estressores antrópicos locais (poluição e pesca) na Baía de Todos os Santos podem explicar os padrões encontrados. Assim, recomenda-se um maior controle dos impactos locais, como pesca e poluição, por meio da implementação de planos de manejo de área marinha protegida já existente na região e da reavaliação de cotas para retirada de peixes para fins ornamentais  previamente estabelecidas no país.  A proteção efetiva de áreas marinhas pode potencialmente alterar as interações entre peixes e esponjas e indiretamente nas interações com corais hermatípicos, influenciando a integridade e o funcionamento dos recifes de corais.

 Os recifes de corais são um dos ecossistemas mais importantes do ponto de vista biológico e econômico do planeta, oferecendo bens e serviços ecossistêmicos como proteção costeira, biodiversidade, materiais de construção, compostos bioquímicos, turismo e pesca. Todos esses bens e serviços ecológicos têm sido mantidos graças a uma estrutura tridimensional, os recifes de coral, construído por organismos bioconstrutores. A forma de crescimento e hábito dos bioconstrutores definem o volume e a rigidez dos recifes de corais. Por exemplo, bioconstructures com formas de crescimento do tipo ereta, maciça, ramificadas irão alterar a complexidade estrutural dos recifes. O crescimento de corais (ou calcificação) é descrito como um processo "biologicamente controlado" e "dependente da fotossíntese" devido a ser restringido a um ambiente delimitado, e por usar uma estrutura de matriz orgânica presente no holobionte (coral-alga) e, também, por depender dos produtos da fotossíntese. Estas algas, dinoflageladas do gênero Symbiodinium (comumente referidas como zooxanthellae), mantém uma relação simbiótica com espécies de corais, e são a razão pela qual os recifes de corais se desenvolvem na região dos trópicos Os recifes de corais brasileiros, pertencentes a região do Atlântico Oeste, são destacados destacam-se pelo Banco dos Abrolhos que contém os recifes de corais mais diversos e desenvolvidos do Oceano Atlântico Sul. Os recifes dos Abrolhos destacam-se dos demais recifes brasileiros devido à sua estrutura, a forma de crescimento semelhante a um cogumelo (Chapeirão), o alto endemismo, a baixa diversidade da fauna de corais e ao modelo de deposição de sedimento, que varia entre os recifes costeiros e ao largo da costa. Esta característica estabeleceu um padrão na comunidade de corais ao longo dos recifes devido à diferença na turbidez e consequentemente a disponibilidade de luz que atinge os recifes. A disponibilidade de luz varia em função da profundidade e da concentração do material em suspensão, assim, uma vez   que   os   corais   dependem   da   luz   refratada   para   realizar   a   fotossíntese   e, consequentemente, realizar o processo de calcificação, diferenças na comunidade de corais são esperadas. Durante sete anos consecutivos (2010-2016), recifes costeiros e ao largo da costa do banco dos Abrolhos foram avaliados através do protocolo AGRRA. Os dados do AGRRA foram utilizados para estimar o valor de bioconstrução das cinco principais espécies de corais encontradas em Abrolhos: Mussismilia braziliensis, M. hispida, M. harttii, Montastraea cavernosa e Siderastrea stellata. Além dos dados do AGGRA um experimento de campo avaliou a função metabólica de Mussismilia braziliensis, M. hispida, Montastraea cavernosa and Siderastrea stellata.   Os nossos resultados apontam uma alta variabilidade no valor de bioconstrução entre as espécies estudadas, e também entre os recifes analisados. Houve também diferença na produtividade bruta diária e assinatura fotossintética entre espécies. Os resultados mostram que M. braziliensis tem um desempenho metabólico superior às demais espécies estudadas. No entanto, uma observação pertinente é o papel secundário de M. cavernosa e S. stellata   na construção de alguns recifes. Devido a ser uma espécie resistente a taxas elevadas de sedimentação, e por ser adaptada a um ambiente de luz reduzida M. cavernosa tem assumido um papel secundário no desenvolvimento das áreas mais sombreadas dos recifes costeiros, e Mussismilia harttii demonstrou ser a espécie mais frequente dos recifes costeiros, junto a M. braziliensis. Além disso, a espécie S. Stellata, que também possui alta tolerância a estresse ambientais, juntamente com M. braziliensis contribuem para o desenvolvimento dos recifes do Parcel dos Abrolhos (PAB). Assim sendo, a causa subjacente do domínio de M. braziliensis é sua resistência a elevada taxa de sedimentação, e principalmente devido aos seus simbiontes, Symbiodinium clado A4 e C3, que possuem características que conferem a espécie M. braziliensis uma vantagem competitiva em condições de alta turbidez e alta irradiância.

Capítulo 1: Abordagens baseadas em traços são uma linha de pesquisa promissora para compreender os efeitos das mudanças ambientais no funcionamento dos ecossistemas por meio de mudanças na dinâmica das comunidades. Mesmo quando esse arcabouço representa um avanço fundamental na compreensão dos sistemas naturais, muitas dificuldades surgem para sua implementação. Neste trabalho, detalhamos três passos que, esperamos, esclareçam a aplicação de um framework de resposta e efeito. O procedimento foi aplicado para entender a resposta dos pequenos mamíferos à perda florestal e os impactos que a comunidade alterada tem na regeneração florestal e na propagação de doenças. Em primeiro lugar, foram identificadas as características relevantes de resposta e efeito; em segundo lugar, o grau de sobreposição entre as características foi analisado por meio de procedimentos estatísticos. Finalmente, foi construído um modelo conceitual relacionando mudanças ambientais e processos ecossistêmicos via sobreposição de características de resposta e efeito. Foram discutidos os principais avanços e dificuldades.

Capítulo 2: A atual crise de biodiversidade, que é impulsionada principalmente pela perda de habitat, levanta preocupações sobre o futuro do funcionamento dos ecossistemas e os serviços que eles fornecem. Neste trabalho, um framework de características de resposta e efeito foi aplicado para predizer os efeitos da perda florestal sobre os serviços ecossistêmicos mediados por pequenos mamíferos da Mata Atlântica. Para tanto, procedimentos estatísticos foram utilizados para agrupar espécies com características semelhantes para responder à perda de floresta e impactar o funcionamento do ecossistema.  As respostas foram traduzidas em efeitos seguindo a trajetória das abundâncias dos grupos funcionais ao longo de um gradiente de perda de habitat na escala da paisagem. Os resultados empíricos apontam para os efeitos negativos da perda florestal sobre os grupos de resposta com certa combinação de características, com o potencial de interromper a prestação de serviços ecossistêmicos em paisagens mais degradadas. O papel regulador da diversidade na transmissão de doenças pode ser comprometido pela perda florestal, assim como a contribuição da comunidade para a regeneração florestal.

A bioinvasão é uma das principais causas de perda da biodiversidade e tem trazido impacto econômico e social em diversas partes do planeta. As espécies invasoras podem competir por recursos e reduzir a abundância de espécies nativas o que pode alterar a estrutura de comunidades biológicas nativas. O coral-sol Tubastraea spp. oriundo do Indo-Pacífico foi introduzido no Atlântico na década de 40. No Brasil, o primeiro registro foi feito na década de 80, e atualmente, no sudeste do Brasil, o coral-sol é considerado uma espécie invasora capaz de competir e matar espécies nativas e alterar a estrutura de comunidades bentônicas nativas. Recentemente, foi encontrado o coral-sol nos recifes de corais da Baía de Todos os Santos, Bahia, sendo este o primeiro registro desse invasor nos recifes de corais do Atlântico Sul ocidental. Contudo, os efeitos desse coral invasor nas comunidades de recifes de corais nunca foram de fato avaliados. Os recifes de corais são ambientes complexos e biodiversos nos quais o espaço é um recurso limitado para as espécies bentônicas, o que pode reduzir a susceptibilidade aos efeitos da invasão devido ao grande número de competidores. Nós estudamos interações diretas entre o coral-sol Tubastraea tagusensis e duas espécies abundantes de corais nativos bem como os efeitos dessa espécie invasora na estrutura da comunidade bentônica de um recife de coral na costa leste da Ilha de Itaparica, Baía de Todos os Santos. As espécies de corais nativos, Siderastrea stellata e Montastrea cavernosa, sofreram necrose tecidual com cinco dias de contato sem causar danos ao coral invasor e, após 60 dias de contato foi observado um aumento significativo da mortalidade S. stellata. Nós também encontramos menores abundancias de duas espécies de corais nativos (Mussismilia hispida e Madracis decatis) na zona recifal invadida quando comparada com duas zonas não invadidas. Além disso, a estrutura das assembleias dos grupos macrobentônicos (e.g. corais hermatípicos e algas filamentosas) também mostrou diferença no padrão cobertura entre as zonas invadidas e não invadidas. Portanto, os ecossistemas recifais da costa brasileira podem estar seriamente ameaçados. Nós recomendamos ações de controle e monitoramento de longo prazo para minimizar a expansão desse invasor na região nordeste do Brasil