A redundância funcional é um mecanismo que ajuda a manter processos ecológicos chave e garante a funcionalidade dos ecossistemas, mesmo com a perda de espécies. Embora seja amplamente estudado em animais e plantas, pouco se compreende sobre a redundância funcional em comunidades microbianas, apesar da importância dessas comunidades para manutenção de inúmeros serviços ecossistêmicos. Os microrganismos raros, caracterizados por apresentarem uma abundância relativa abaixo de 0,01%, desempenham um papel chave para manutenção dos serviços ecossistêmicos. No entanto, esses microrganismos são frequentemente negligenciados nos estudos de redundância funcional em comunidades microbianas. Neste estudo, buscamos preencher essa lacuna de conhecimento, coletando uma extensa quantidade de amostras metagenômicas. Foram obtidas 6.794 amostras provenientes de 73 habitats, distribuídos em 9 ecossistemas em todo o planeta. A partir dessas amostras, realizamos uma análise detalhada da redundância funcional presente nas comunidades microbianas de diversos ecossistemas. Para compreender a relação entre a abundância relativa e a riqueza dos microrganismos raros e os índices de redundância funcional encontrados, empregamos uma regressão linear simples. Consideramos significativos os resultados das análises que apresentaram um valor de p < 0,05. Nossas descobertas demonstram diferenças significativas na redundância funcional entre os ecossistemas estudados. Além disso, os dados indicam que a redundância funcional das comunidades microbianas é fortemente influenciada pelo estilo de vida dos microrganismos e os ambientes nos quais eles estão inseridos. Nossos dados também revelaram que comunidades microbianas com alta riqueza de microrganismos raros geralmente possuem redundância funcional reduzida apontando que os microrganismos raros podem ser importantes na realização de funções altamente especializadas e distintas em cada ambiente e sua extinção poderia desencadear efeitos em cascatas reduzindo a funcionalidade dos ecossistemas.

Poli-β-(1,6)-N-acetilglucosamina (PNAG) é um polissacarídeo de superfície amplamente expresso e presente na matriz de biofilme de diferentes espécies bacterianas. PNAG é um fator de virulência, envolvido na proteção contra as defesas inatas do hospedeiro, antibioticoterapia e das condições de estresse do ambiente. Leptospiras patogênicas são os agentes etiológicos da leptospirose, uma antropozoonose de distribuição mundial, com impacto na saúde humana e animal. Leptospira forma biofilmes no ambiente e nos rins do reservatório Rattus norvegicus. No entanto, informações sobre a composição da matriz exopolimérica de biofilmes de Leptospira, bem como as proteínas envolvidas na expressão de PNAG, são pouco caracterizadas. Neste trabalho nós avaliamos a expressão de PNAG por Leptospira através de abordagens de imunofluorescência (IF), bioquímica e genômica. Através da IF, demonstramos que PNAG é expresso na superfície celular de Leptospira com diferentes graus de patogenicidade e está presente na matriz exopolimérica do biofilme. O tratamento bioquímico com metaperiodato de sódio clivou as ligações N-acetilglicosamina-β-(1,6) confirmando a presença de PNAG. Através de análise genômica comparativa identificamos proteínas com similaridade a glicosiltransferases e desacetilases relacionadas à expressão de PNAG. Nesse estudo, demonstramos a presença de PNAG em Leptospira no fenótipo planctônico e na matriz do biofilme. Nosso estudo expande o conhecimento acerca da composição do biofilme de Leptospira e contribui para a compreensão dos possíveis mecanismos de sobrevivência de Leptospira no ambiente e na relação patógeno-hospedeiro.

Os fungos que ocupam ambientes de água doce têm sido relatados como produtores de metabólitos de ampla diversidade química e ampla gama de atividades biológicas. Dentre os grupos de fungos que ocorrem nesses ambientes, estão os fungos mitospóricos, que consistem em estados assexuados, principalmente de ascomicetos e alguns basidiomicetos. Os hifomicetos aquáticos são fungos mitospóricos reconhecidos, principalmente, pelo protagonismo na decomposição de matéria orgânica foliar alóctone em ambientes lóticos e pela capacidade de esporular abaixo da superfície. O principal objetivo desse trabalho consiste em avaliar o potencial biotecnológico dos fungos mitospóricos de água doce. O capítulo 1 tratase de uma revisão integrativa sobre a produção metabólica dos hifomicetos aquáticos e suas aplicações biotecnológicas. Os resultados apontaram este grupo como importantes produtores de diversos metabólitos com aplicações em vários setores da indústria, agricultura e saúde, principalmente enzimas associadas a quebra de compostos lignocelulolíticos e com potencial antimicrobiano. O capítulo 2 é um trabalho experimental que teve como objetivo avaliar a atividade antimicrobiana de quatro espécies de fungos mitospóricos isolados em diferentes riachos associados a material vegetal em decomposição. Os fungos foram cultivados em diferentes meios de cultura e seus extratos brutos foram testados contra nove patógenos bacterianos e fúngicos com a técnica de micrdiluição em caldo. Os fungos F. curvula, A. penicillioides e a cepa 133057 de P. submersus inibiram a maioria dos patógenos bacterianos, mas nenhum apresentou atividade antifúngica. Cepas da mesma espécie coletadas de ambientes diferentes e extratos de cultivos em diferentes meios de cultura apresentaram divergências quanto a bioatividade, sendo estes, aspectos importantes a serem considerados na bioprospecção de atividade antimicrobiana

A pandemia de COVID-19, causada pelo vírus SARS-CoV-2 (Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2), teve início na província de Wuhan na China e se espalhou rapidamente pelo globo gerando impactos socioeconômicos e na saúde pública. A descoberta do agente viral causador da doença só foi possível graças às novas tecnologias de sequenciamento de ácidos nucléicos, conhecidas conjuntamente como NGS (da sigla em inglês Next Generation Sequencing). Atualmente, essas mesmas tecnologias estão sendo empregadas para vigilância genômica do vírus a partir da descoberta de mutações e determinação de novas variantes. Em 2022, a Organização Mundial da Saúde emitiu uma estratégia global de vigilância genômica para patógenos de potencial pandêmico e epidêmico (2022-2032). A fim de contribuir com essa estratégia e visando melhorar o acesso a ferramentas de detecção viral este trabalho tem como objetivo principal implementar, comparar e validar protocolos de análise que utilizem apenas dados brutos de NGS (arquivos FASTQ) para diagnóstico e chamada de variante de SARS-CoV-2. Para isso, foram utilizados como universo amostral um total de 15 novos sequenciamentos de SARS-CoV-2 obtidos por metodologia direcionada Ion Ampliseq (n=10) ou por abordagem metatranscriptômica (n= 5). Tais arquivos FASTQ foram submetidos à montagem a partir dos montadores automatizados: PATRIC, BVBRC, ID-seq, CoronaSPAdes e Genome Detective. A chamada de variante foi realizada a partir das plataformas GISAID, Genome Detective, Nextclade e BV-BRC que possui abordagem integrada de montagem e anotação. As análises ocorreram em dois momentos, a fim de identificar possíveis mudanças nos resultados após atualizações das plataformas. Os resultados gerados foram comparados, entre outros aspectos, em relação à capacidade da chamada de variante de SARS- CoV-2, tempo médio gasto para realizar análise, ORFs virais identificadas e porcentagem do conteúdo G+C do genoma montado. Inicialmente a plataforma BV-BRC demonstrou ser a plataforma capaz de determinar a variante corretamente, com o maior número de resultados gerados e no menor tempo. O ID-seq e Genome Detective se mostraram capazes de realizar a montagem do genoma e, a partir dos arquivos FASTA gerados, foi possível realizar a chamada de variante utilizando as plataformas Nextclade e o próprio Genome Detective para a anotação. Após atualizações o BV-BRC apesar de ainda gerar o maior número de resultados no menor tempo, apresentou menor especificidade na chamada de variantes. O Genome Detective,no entanto, apresentou uma abordagem integrada de montagem e anotação com uma maior capacidade de determinar a variante. O montador PATRIC e a plataforma de anotação GISAID não foram capazes de gerar resultados de maneira satisfatória para as amostras avaliadas.

Existem diversos patógenos que se configuram ameaças constantes tanto para saúde pública humana como para agricultura, levando a grandes impactos sociais e econômicos. Atualmente, os vírus encontram-se em maior destaque pela rápida taxa mutacional e espalhamento, serem influenciados pelo ambiente e estarem associados a grande amplitude de hospedeiros, infectando desde mamíferos superiores até organismos unicelulares. O exemplo mais recente relacionado à saúde pública humana é o SARS-CoV-2, que possui rápida disseminação associada à ausência de imunidade populacional, levando ao cenário pandêmico. Existem também vírus associados a outros microrganismos, como fungos. Muitos fungos causam grande impacto na agricultura, como Ceratocystis que que infecta diversas plantas de importância agrícola como a manga e o eucalipto, impactando a produtividade podendo levá-las à morte. Com isso, o monitoramento se torna estratégia importante para avaliação epidemiológica de agentes infecciosos e dos microrganismos associados que podem impactar no resultado das infecções, causando tanto hipovirulência quanto hipervirulência. Novas ferramentas computacionais podem ajudar no desenvolvimento de ações mais eficientes no monitoramento e desenvolvimento de estratégias de manejo das doenças. Métodos robustos auxiliam na avaliação de dados complexos permitindo rápido monitoramento de ameaças. Tendo isso em vista, o objetivo deste projeto foi avaliar e aplicar a metatranscriptômica como ferramenta de identificação de patógenos em amostras derivadas de diferentes organismos. Para tal, foram analisados dados de pacientes positivos para COVID-19 do Estado da Bahia, e a biblioteca pública do fungo Ceratocystis cacaofunesta. Em ambos os casos foi realizada parte da análise de bioinformática através da plataforma on-line Galaxy e a classificação taxonômica foi realizada com as ferramentas Kaiju e Kraken. Para a Ceratocystis também foi utilizado o programa BLAST visando a busca de similaridade, HMMER e InterProScan com o objetivo de encontrar os domínios conservados, AliView para edição das sequências, MAFFT para realizar o alinhamento global, CIPRES para busca do melhor modelo e construção da árvore filogenética e, por fim, o iTol para visualização da árvore filogenética. Após as análises, para as amostras derivadas de humanos sabidamente infectados com SARS-CoV-2, existiam, principalmente, bactérias presentes no trato respiratório desses indivíduos. Com isso, os dados foram comparados com a literatura visando avaliar quais microrganismos pertencem ao trato respiratório e identificar quais das espécies encontradas têm potencial ou já foram descritas agindo como patógenos oportunistas co-circulando com o SARS-CoV-2. Já para o fungo Ceratocystis, foram encontradas diversas sequências virais, incluindo pertencentes às famílias Hypoviridae, Mymonaviridae, Narnaviridae e Partitiviridae. Também foram observados domínios conservados associados às sequências, além de ter confirmada a designação a nível de família dos novos vírus através da análise filogenética. Em suma, análises metagenômicas associadas à bioinformática têm se mostrado essenciais para melhor compreensão e monitoramento de patógenos e nosso trabalho reforçou o potencial do Sequenciamento de Nova Geração de RNAs nesse processo.

Candida spp. é o principal gênero fúngico associado a infecções em seres humanos, e seu tratamento vem se tornando um desafio devido à produção de biofilme e ao seu perfil de resistência/multirresistência a antifúngicos convencionais. A terapia fotodinâmica antimicrobiana se destaca como tratamento caracterizado pelo amplo espectro de ação antimicrobicida, sendo capaz de induzir estresse oxidativo em microrganismos, e as porfirinas são fotossensibilizadores com alta seletividade aos patógenos. Dessa forma, este trabalho teve como objetivo analisar a fotoinativação de diferentes espécies de Candida por duas porfirinas catiônicas (4-H₂TMeP⁺ e 3-H₂TMeP⁺) e uma aniônica (4-H₂TPSP^-). Foram realizados ensaios de microdiluição para determinação de CIM₁₀₀, posterior determinação de CFM₁₀₀, verificação da ação sobre biofilme, efeito potencializante do iodeto de potássio, determinação de espécie oxidativa envolvida através do uso de sequestradores, e análises em microscopia de força atômica (AFM). As porfirinas catiônicas foram significativamente eficientes na inativação de Candida albicans e espécies não-albicans com 100% de inibição de crescimento e atividade fungicida (CFM₁₀₀/CIM₁₀₀ < 4). As porfirinas catiônicas demonstraram interferência na formação de biofilme de Candida spp. O mecanismo fotooxidativo ativado por 3-H₂TMeP⁺ em Candida spp. envolveu principalmente a produção de oxigênio singleto. O efeito fotooxidante nessas leveduras foi potencializado com a adição de iodeto de potássio. Na AFM, 3-H₂TMeP⁺ foi capaz de reduzir a adesão de C. parapsilosis em superfície. Assim, conclui-se que o uso de fotossensibilizadores porfirínicos tem significativo potencial de originar um tratamento alternativo e/ou complementar para infecções causadas por diferentes espécies de Candida.

Serratia marcescens é uma espécie ubíqua com um comportamento complexo no ambiente, agindo como um patógeno oportunista em animais e vegetais, endossimbionte através de endofitismo e também encontrado em forma de vida livre em solos, água e alimentos. Para o estabelecimento de uma relação microrganismohospedeiro, é necessário que as bactérias sejam capazes de colonizar, adaptar-se e aderir aos tecidos hospedeiros internos. Para isso, as bactérias desenvolveram diversos sistemas de secreção, que desempenham um papel importante na adesão, motilidade, competição com outros microrganismos, e na secreção de fatores de virulência. Neste trabalho descrevemos a seqüência genômica, montagem e anotação do isolado fitopatogênico S. marcescens BP2 seguido por análises comparativas de sete genomas de S. marcescens, sendo eles dos patógenos oportunistas de humanos, dois endófitos, um fitopatogênico e dois de vida livre, depositados no banco de dados do NCBI. O objetivo deste estudo foi compreender as relações filogenéticas e identificar genes e os sistemas de secreção correlacionados com o estilo de vida diverso deste grupo de bactérias. As análises filogenômicas e de ANI, revelaram a ocorrência de dois diferentes grupos na árvore taxonômica: um composto de fitopatogênicos e de vida livre e um de endofíticas e patogênicas oportunistas. Complementarmente, a busca de grupos de genes ortólogos demonstraram que todas as cepas compartilham um total de 3862 clusters, enquanto os mesmos grupos presentes nas análises filogenômicas, compartilham uma maior quantidade de clusters entre si. A busca por componentes estruturais dos sistemas de secreção foi realizada através da ferramenta TXSScan e foi possível encontrar a presença dos sistemas do tipo I, V e VI em todos os isolados. Além do mais, pudemos observar a presença de diversos fatores de virulência em cepas patogênicas e igualmente em cepas endofíticas, sugerindo que esses genes possam contribuir para a competitividade e a capacidade de adaptação dessa bactéria no ambiente. Por fim, a apresentação de um genoma completo de S. marcescens fitopatogênica pode auxiliar em futuros estudos pangenômicos desta espécie.

A tuberculose é uma doença infecto-contagiosa causada por micobactérias do Complexo Mycobacterium tuberculosis (CMTB), doença que afeta primariamente os pulmões. O uso de ferramentas baseadas em biologia molecular tem permitido o avanço no campo da medicina humana, animal e ambiental, trazendo muitos benefícios no diagnóstico das doenças infecciosas, reduzindo significativamente o tempo desde o diagnóstico até a instituição do tratamento aliado a esse avanço, técnicas como o spoligotyping associado a epidemiologia clássica tem permitido identificar cadeias de transmissão podendo ser usado para avaliar a eficiência dos programas de controle da doença em diversas partes do mundo. O presente estudo objetiva-se investigar a diversidade genética de cepas do complexo MTB isoladas de pacientes em um centro de referência em investigação da tuberculose. Foram incluídos neste estudo isolados bacterianos pertencentes ao complexo MTB, oriundos de amostras de escarro enviadas ao Laboratório de Bacteriologia da Fundação Jose Silveira para diagnóstico micobacteriológico, com descontaminação pelo método NALC-NaOH, durante o período de 2016 a 2018. Os isolados foram genotipados pela técnica spoligotyping e os resultados foram analisados visualmente e inscritos em formato binário e comparados com os padrões descritos no banco de dados SITVIT a fim de identificar o Spoligo Internacional Type (SIT) correspondente. As 46 amostras com perfil genético completo na hibridização foram classificadas em 26 SIT. A linhagem LAM foi a mais frequente 43,1% (22/51). Em relação à sensibilidade antimicrobiana dos 150 isolados genotipados como M.tuberculosis, 143/150 (95,3%) apresentaram sensibilidade in vitro a todas as drogas testadas enquanto 7/150 (4,7%) apresentaram resistência a pelo menos uma droga anti-TB. A genotipagem auxiliou na descoberta de casos epidemiologicamente relacionados, foi possível observar três regiões com maior concentração de casos nos bairros. Acreditamos que o conhecimento sobre as características desses pacientes irá contribuir para o desenvolvimento de políticas que visem melhorar o diagnóstico e tratamento dos pacientes. Sendo assim, esse estudo muito contribuirá para o fornecimento de indicadores laboratoriais para o controle da tuberculose e servirá na tomada de decisão pelos municípios brasileiros.

Ratos urbanos (Rattus spp.) são considerados reservatórios naturais de vários patógenos zoonóticos incluindo espécies de enterobactérias que são responsáveis por diversas doenças infecciosas que acometem os seres humanos. Em virtude da falta de estudos avaliando a ocorrência de enterobactérias nesses animais em países tropicais como o Brasil, bem como a crescente emergência de resistência antimicrobiana, o presente trabalho teve como objetivo determinar a prevalência de enterobactérias com potencial zoonótico em ratos urbanos em Salvador. Os roedores foram capturados no período de abril à junho de 2018. Foram realizadas coletas de fezes através de swab retal, subsequentemente, cultivadas em meio de cultivo seletivos. Para identificação microbiológica, foram realizadas provas bioquímicas e caracterização sorológica. As amostras de Salmonella foram submetidas ao Vitek® para confirmação da espécie e perfil de sensibilidade. Os isolados de Escherichia coli foram submetidos à pesquisa de resistência à ceftriaxona e ertapenem. As cepas de Klebsiella pneumoniae foram avaliadas fenotipicamente para produção de β-lactamases de espectro estendido (ESBL). Foram capturados 72 ratos, 67 Rattus norvegicus e cinco Rattus rattus. Desses animais, foram isolados oito gêneros de enterobactérias: Escherichia 70,8 %, Citrobacter 38,9 %, Enterobacter 16,7 %, Klebsiella 16,7 %, Serratia 8,3 %, Proteus 4,2 %, Kluyvera 1,4 % e Salmonella 1,4 %. Salmonella foi resistente à cefalotina, cefuroxima, cefuroxima axetil, amicacina e gentamicina. Os isolados de E. coli foram sensíveis à ceftriaxona e ertapenem. As cepas de K. pneumoniae apresentaram fenótipo negativo para ESBL. E. coli diarreiogênicas (ECD) foram isoladas em 31,3 % dos 67 R. norvegicus. Os patotipos detectados com mais frequência foram E. coli produtora da toxina shiga (STEC) em 11,9 %, seguida de E. coli enteropatogênica atípica (aEPEC) em 10,4 % e E. coli enteroinvasora (EIEC) em 4,5 %. Dos cinco R. rattus, 40 % apresentaram ECD. Shigella não foi isolada de nenhum dos ratos analisados. Os achados de que os ratos albergam essas enterobactérias contribuem para aumentar a importância desses roedores como uma fonte potencial de agentes patogênicos para seres humanos, mas a epidemiologia destes microrganismos precisa ser investigada, assim como seu impacto na saúde dos moradores expostos a esses animais

Introdução e objetivos: O vírus zika (ZIKV) é veiculado principalmente pelo Aedes aegypti, que encontrou nas Américas condições favoráveis a sua propagação. Ocorrem nas cidades o ressurgimento de surtos, levando-nos a investigação da possibilidade do ZIKV manter-se na natureza através de uma nova via disseminadora. O objetivo deste estudo foi avaliar, após infecção experimental oral do Ae. aegypti com ZIKV, a replicação, excreção viral e capacidade infectante do vírus nas excretas. Métodos: Mosquitos foram infectados com ZIKV e acompanhados sequencialmente para avaliar a excreção viral pelas fezes, o intestino, túbulos de Malpighi e glândula salivar foram dissecados para verificar a presença do vírus por RT-qPCR. Analisamos por isolamento viral em cultivo celular a capacidade infectante do vírus das excretas. Resultados: Identificamos a presença do ZIKV nas excretas entre 1 a 3, 6 a 10, 14 e 15 dias pós-infecção (dpi). Verificamos a presença viral no intestino, túbulo de Malpighi com 6 e 11 dpi e na glândula salivar com 13 e 15 dpi. Confirmamos por isolamento viral em cultivo celular a excreção do vírus comprovadamente infeccioso. Discussão e conclusão: A presença viral com 3 dpi já não condiz com uma carga viral residual já que a digestão total do sangue já ocorreu. A detecção do ZIKV presente no intestino e nos túbulos de Malpighi e posteriormente na glândula salivar sugere a disseminação do vírus. A replicação viral em células C6/36 inoculadas com as excretas demostra que o vírus conserva-se viável. Os resultados sugerem uma possível via secundária potencial para propagação do ZIKV na natureza.

Grande parte da comercialização de camarão em países tropicais é in natura e
realizada através do comércio informal, com precária condição higiênico-sanitária, favorecendo a contaminação
do alimento, principalmente por E. coli e consequente risco de infecção entérica para a população, através da
exposição a cepas virulentas produtoras de ESBL e com relevância para a saúde pública. Objetivou-se a
investigação de genes de virulência e de resistência em isolados de E. coli, obtidos de camarões (Litopenaeus
vannamei), comercializados informalmente, através da identificação fenotípica e molecular. Para tanto, foram
coletadas 22 amostras de camarões (500g, cada). Após maceração e diluição seriada, foi determinado o índice
colimétrico para coliformes totais e termotolerantes e em seguida, o cultivo para isolamento e identificação
fenotípica pelo sistema automatizado (VITEK® 2), bem como o teste para a resistência microbiana. Quanto à
pesquisa dos genes de virulência e resistência realizou-se a reação em cadeia da polimerase para a
caracterização molecular. Foram obtidos 24 isolados de E. coli, sendo 17 cepas comensais (17/24 - 70,8%) e sete
cepas patogênicas (7/24 – 29,2%), incluindo quatro isolados EIEC (4/7 – 57,1%), dois isolados STEC (2/7 –
28,6%); um EHEC do sorotipo O157: H7 (1/7 – 14,3%) e uma híbrida STEC/ETEC (1/7 – 14,3%). O gene
codificador de ESBL CTX-M foi identificado em 25% dos isolados (uma EHEC e cinco comensais). A identificação
de patotipos de E. coli com perfil de resistência em camarões demonstra a circulação de genes e a relevância
para a saúde pública uma vez que contribui para ocorrência de infecções resistentes à abordagem terapêutica,
principalmente em países com fins turísticos, os quais recepcionam pessoas de diversas nacionalidades, o que
ratifica a importância da segurança alimentar para a saúde pública.

Arbovírus (Arthropod-borne virus) são vírus transmitidos através da picada de artrópodes hematófagos e, portanto, responsáveis por causar doenças conhecidas por arboviroses. Com sintomatologia clínica muito semelhante e inespecífica, como febre, dores de cabeça, mialgia e artralgia, as arboviroses representam um grave problema de saúde pública mundial com impactos sociais e econômicos relevantes. Entre os arbovírus brasileiros, os vírus Chikungunya (CHIKV), Dengue (DENV), Febre Amarela (YFV), Mayaro (MAYV), Oropouche (OROV), Rocio (ROCV) e Zika (ZIKV) são responsáveis pela maioria dos casos de arboviroses humanas no Brasil. No entanto, com exceção dos vírus CHIKV, DENV,  YFV e ZIKV, não se tem informações sobre a circulação desses vírus no estado da Bahia. A emergência de arbovírus como CHIKV e ZIKV em centros urbanos do Brasil, ressalta a preocupação com o surgimento de outros arbovírus não encontrados anteriormente em outras regiões do país para além da Região Amazônica. Dito isso, o presente estudo teve como objetivo pesquisar a presença dos arbovírus MAYV, OROV e ROCV em amostras de soro, urina e saliva de pacientes residentes no Estado da Bahia com suspeita clínica de dengue. Esses pacientes manifestaram sintoma febril além de outros sintomas como: artralgia, cefaleia, mialgia, vômito e diarréia. Foram analisadas 554 amostras provenientes de unidade hospitalar privada de Salvador cujos testes para DENV, CHIKV e ZIKV apresentaram-se negativos. RT-PCR e nested-PCR foram realizados para detecção dos vírus MAY, ORO e ROC. Nenhuma amostra foi positiva para MAYV e ROCV e 18 amostras foram positivas para OROV dentre elas 6 de soro, 7 de saliva e 5 de urina. Esta foi a primeira vez que o OROV foi identificado no Brasil fora da região amazônica, no Estado da Bahia e em amostras de saliva e urina. Foi realizado sequenciamento do fragmento do gene codificante para as proteínas N e NSs do OROV de 7 amostras positivas e a análise filogenética mostrou que o vírus presente na Bahia agrupa-se ao genótipo I, o genótipo mais encontrado na Região Amazônica brasileira. A detecção do OROV na Bahia mostra a necessidade de um sistema de vigilância eficiente para controlar a disseminação deste vírus na população. Além disso, este trabalho sugere a utilização de amostras de saliva e urina como alternativa para a detecção de OROV quando amostras de soro são inviáveis.