As Doenças Veiculadas por Alimentos (DVAs) constituem eventos de saúde pública de notificação compulsória imediata e frequentemente estão associadas ao consumo de produtos de origem animal contaminados por bactérias. No Brasil, Escherichia coli o principal patógeno envolvido em surtos de DVAs. Nos últimos anos, os produtos avícolas caipiras apresentaram maior visibilidade no mercado. No entanto, pode ocorrer negligência quanto à vigilância sanitária para comercialização destes produtos, o que propicia risco sanitário devido à maior possibilidade de veiculação de microrganismos patogênicos, inclusive resistentes a antimicrobianos. Objetivou-se investigar a presença de Escherichia coli em produtos avícolas caipiras comercializados informalmente e avaliar a circulação de cepas de E. coli diarreiogênicas e resistentes a antimicrobianos. Assim, foram analisados 38 pools de ovos caipiras e 26 carcaças de frangos caipiras oriundos de pontos informais de comercialização na cidade de Salvador-Bahia. A partir destas amostras, 30 isolados foram identificados como Escherichia coli por MALDI-TOF, perfazendo taxa de 92,3% (24/26 carcaças) de contaminação das amostras de carne e 15,8% (6/38 pools) das amostras de ovos. Os isolados foram submetidos ao sistema VITEK®2 para determinar o padrão de suscetibilidade a classes de antimicrobianos clinicamente relevantes, como penicilinas, cefalosporinas e carbapenêmicos do grupo β-lactâmicos, aminoglicosídeos e quinolonas. Identificou-se índice total de 46,7% (14/30) de resistência a pelo menos um dos antimicrobianos testados, com 35,7% (5/14) caracterizados como multirresistentes por apresentarem resistência a três ou mais classes de antimicrobianos. A prevalência de resistência foi maior para Ciprofloxacina com 33,3% (10/30), Ceftriaxona com 26,7% (8/30) e Ampicilina/Sulbactam com 20% (6/30). Ademais, 8/30 (26,7%) apresentaram fenótipo para produção de beta-lactamase de espectro estendido (ESBL). Na caracterização molecular por PCR, 60% (18/30) dos isolados de E. coli foram caracterizados como pertencentes ao grupo DEC, com maior prevalência para o patotipo EAEC atípico, [38,9% (7/18)] e DAEC [22,0% (4/18)], além da caracterização de cepas híbridas. Dos 30 isolados, 19 (63,3%) apresentaram ao menos um gene de resistência a β-lactâmicos, com maior frequência observada para os genes blaCTX-M 1 e blaTEM, com 63% (12/19) e 47% (9/19), respectivamente, seguido por blaOXA-1 e blaSHV com 10,5% (2/19) cada. A detecção de E.coli diarreiogênicas, multirresistentes e/ou produtoras de ESBL em produtos avícolas caipiras comercializados em país com fins turísticos ratifica o potencial de veiculação destes microrganismos através de animais de produção, com consequente contribuição para ocorrência de DVAs e emergência global de resistência a antimicrobianos.

Candida spp. é o principal gênero fúngico associado a infecções em seres humanos, e seu tratamento vem se tornando um desafio devido à produção de biofilme e ao seu perfil de resistência/multirresistência a antifúngicos convencionais. A terapia fotodinâmica antimicrobiana se destaca como tratamento caracterizado pelo amplo espectro de ação antimicrobicida, sendo capaz de induzir estresse oxidativo em microrganismos, e as porfirinas são fotossensibilizadores com alta seletividade aos patógenos. Dessa forma, este trabalho teve como objetivo analisar a fotoinativação de diferentes espécies de Candida por duas porfirinas catiônicas (4-H₂TMeP⁺ e 3-H₂TMeP⁺) e uma aniônica (4-H₂TPSP^-). Foram realizados ensaios de microdiluição para determinação de CIM₁₀₀, posterior determinação de CFM₁₀₀, verificação da ação sobre biofilme, efeito potencializante do iodeto de potássio, determinação de espécie oxidativa envolvida através do uso de sequestradores, e análises em microscopia de força atômica (AFM). As porfirinas catiônicas foram significativamente eficientes na inativação de Candida albicans e espécies não-albicans com 100% de inibição de crescimento e atividade fungicida (CFM₁₀₀/CIM₁₀₀ < 4). As porfirinas catiônicas demonstraram interferência na formação de biofilme de Candida spp. O mecanismo fotooxidativo ativado por 3-H₂TMeP⁺ em Candida spp. envolveu principalmente a produção de oxigênio singleto. O efeito fotooxidante nessas leveduras foi potencializado com a adição de iodeto de potássio. Na AFM, 3-H₂TMeP⁺ foi capaz de reduzir a adesão de C. parapsilosis em superfície. Assim, conclui-se que o uso de fotossensibilizadores porfirínicos tem significativo potencial de originar um tratamento alternativo e/ou complementar para infecções causadas por diferentes espécies de Candida.

Serratia marcescens é uma espécie ubíqua com um comportamento complexo no ambiente, agindo como um patógeno oportunista em animais e vegetais, endossimbionte através de endofitismo e também encontrado em forma de vida livre em solos, água e alimentos. Para o estabelecimento de uma relação microrganismohospedeiro, é necessário que as bactérias sejam capazes de colonizar, adaptar-se e aderir aos tecidos hospedeiros internos. Para isso, as bactérias desenvolveram diversos sistemas de secreção, que desempenham um papel importante na adesão, motilidade, competição com outros microrganismos, e na secreção de fatores de virulência. Neste trabalho descrevemos a seqüência genômica, montagem e anotação do isolado fitopatogênico S. marcescens BP2 seguido por análises comparativas de sete genomas de S. marcescens, sendo eles dos patógenos oportunistas de humanos, dois endófitos, um fitopatogênico e dois de vida livre, depositados no banco de dados do NCBI. O objetivo deste estudo foi compreender as relações filogenéticas e identificar genes e os sistemas de secreção correlacionados com o estilo de vida diverso deste grupo de bactérias. As análises filogenômicas e de ANI, revelaram a ocorrência de dois diferentes grupos na árvore taxonômica: um composto de fitopatogênicos e de vida livre e um de endofíticas e patogênicas oportunistas. Complementarmente, a busca de grupos de genes ortólogos demonstraram que todas as cepas compartilham um total de 3862 clusters, enquanto os mesmos grupos presentes nas análises filogenômicas, compartilham uma maior quantidade de clusters entre si. A busca por componentes estruturais dos sistemas de secreção foi realizada através da ferramenta TXSScan e foi possível encontrar a presença dos sistemas do tipo I, V e VI em todos os isolados. Além do mais, pudemos observar a presença de diversos fatores de virulência em cepas patogênicas e igualmente em cepas endofíticas, sugerindo que esses genes possam contribuir para a competitividade e a capacidade de adaptação dessa bactéria no ambiente. Por fim, a apresentação de um genoma completo de S. marcescens fitopatogênica pode auxiliar em futuros estudos pangenômicos desta espécie.

A tuberculose é uma doença infecto-contagiosa causada por micobactérias do Complexo Mycobacterium tuberculosis (CMTB), doença que afeta primariamente os pulmões. O uso de ferramentas baseadas em biologia molecular tem permitido o avanço no campo da medicina humana, animal e ambiental, trazendo muitos benefícios no diagnóstico das doenças infecciosas, reduzindo significativamente o tempo desde o diagnóstico até a instituição do tratamento aliado a esse avanço, técnicas como o spoligotyping associado a epidemiologia clássica tem permitido identificar cadeias de transmissão podendo ser usado para avaliar a eficiência dos programas de controle da doença em diversas partes do mundo. O presente estudo objetiva-se investigar a diversidade genética de cepas do complexo MTB isoladas de pacientes em um centro de referência em investigação da tuberculose. Foram incluídos neste estudo isolados bacterianos pertencentes ao complexo MTB, oriundos de amostras de escarro enviadas ao Laboratório de Bacteriologia da Fundação Jose Silveira para diagnóstico micobacteriológico, com descontaminação pelo método NALC-NaOH, durante o período de 2016 a 2018. Os isolados foram genotipados pela técnica spoligotyping e os resultados foram analisados visualmente e inscritos em formato binário e comparados com os padrões descritos no banco de dados SITVIT a fim de identificar o Spoligo Internacional Type (SIT) correspondente. As 46 amostras com perfil genético completo na hibridização foram classificadas em 26 SIT. A linhagem LAM foi a mais frequente 43,1% (22/51). Em relação à sensibilidade antimicrobiana dos 150 isolados genotipados como M.tuberculosis, 143/150 (95,3%) apresentaram sensibilidade in vitro a todas as drogas testadas enquanto 7/150 (4,7%) apresentaram resistência a pelo menos uma droga anti-TB. A genotipagem auxiliou na descoberta de casos epidemiologicamente relacionados, foi possível observar três regiões com maior concentração de casos nos bairros. Acreditamos que o conhecimento sobre as características desses pacientes irá contribuir para o desenvolvimento de políticas que visem melhorar o diagnóstico e tratamento dos pacientes. Sendo assim, esse estudo muito contribuirá para o fornecimento de indicadores laboratoriais para o controle da tuberculose e servirá na tomada de decisão pelos municípios brasileiros.

Ratos urbanos (Rattus spp.) são considerados reservatórios naturais de vários patógenos zoonóticos incluindo espécies de enterobactérias que são responsáveis por diversas doenças infecciosas que acometem os seres humanos. Em virtude da falta de estudos avaliando a ocorrência de enterobactérias nesses animais em países tropicais como o Brasil, bem como a crescente emergência de resistência antimicrobiana, o presente trabalho teve como objetivo determinar a prevalência de enterobactérias com potencial zoonótico em ratos urbanos em Salvador. Os roedores foram capturados no período de abril à junho de 2018. Foram realizadas coletas de fezes através de swab retal, subsequentemente, cultivadas em meio de cultivo seletivos. Para identificação microbiológica, foram realizadas provas bioquímicas e caracterização sorológica. As amostras de Salmonella foram submetidas ao Vitek® para confirmação da espécie e perfil de sensibilidade. Os isolados de Escherichia coli foram submetidos à pesquisa de resistência à ceftriaxona e ertapenem. As cepas de Klebsiella pneumoniae foram avaliadas fenotipicamente para produção de β-lactamases de espectro estendido (ESBL). Foram capturados 72 ratos, 67 Rattus norvegicus e cinco Rattus rattus. Desses animais, foram isolados oito gêneros de enterobactérias: Escherichia 70,8 %, Citrobacter 38,9 %, Enterobacter 16,7 %, Klebsiella 16,7 %, Serratia 8,3 %, Proteus 4,2 %, Kluyvera 1,4 % e Salmonella 1,4 %. Salmonella foi resistente à cefalotina, cefuroxima, cefuroxima axetil, amicacina e gentamicina. Os isolados de E. coli foram sensíveis à ceftriaxona e ertapenem. As cepas de K. pneumoniae apresentaram fenótipo negativo para ESBL. E. coli diarreiogênicas (ECD) foram isoladas em 31,3 % dos 67 R. norvegicus. Os patotipos detectados com mais frequência foram E. coli produtora da toxina shiga (STEC) em 11,9 %, seguida de E. coli enteropatogênica atípica (aEPEC) em 10,4 % e E. coli enteroinvasora (EIEC) em 4,5 %. Dos cinco R. rattus, 40 % apresentaram ECD. Shigella não foi isolada de nenhum dos ratos analisados. Os achados de que os ratos albergam essas enterobactérias contribuem para aumentar a importância desses roedores como uma fonte potencial de agentes patogênicos para seres humanos, mas a epidemiologia destes microrganismos precisa ser investigada, assim como seu impacto na saúde dos moradores expostos a esses animais

Introdução e objetivos: O vírus zika (ZIKV) é veiculado principalmente pelo Aedes aegypti, que encontrou nas Américas condições favoráveis a sua propagação. Ocorrem nas cidades o ressurgimento de surtos, levando-nos a investigação da possibilidade do ZIKV manter-se na natureza através de uma nova via disseminadora. O objetivo deste estudo foi avaliar, após infecção experimental oral do Ae. aegypti com ZIKV, a replicação, excreção viral e capacidade infectante do vírus nas excretas. Métodos: Mosquitos foram infectados com ZIKV e acompanhados sequencialmente para avaliar a excreção viral pelas fezes, o intestino, túbulos de Malpighi e glândula salivar foram dissecados para verificar a presença do vírus por RT-qPCR. Analisamos por isolamento viral em cultivo celular a capacidade infectante do vírus das excretas. Resultados: Identificamos a presença do ZIKV nas excretas entre 1 a 3, 6 a 10, 14 e 15 dias pós-infecção (dpi). Verificamos a presença viral no intestino, túbulo de Malpighi com 6 e 11 dpi e na glândula salivar com 13 e 15 dpi. Confirmamos por isolamento viral em cultivo celular a excreção do vírus comprovadamente infeccioso. Discussão e conclusão: A presença viral com 3 dpi já não condiz com uma carga viral residual já que a digestão total do sangue já ocorreu. A detecção do ZIKV presente no intestino e nos túbulos de Malpighi e posteriormente na glândula salivar sugere a disseminação do vírus. A replicação viral em células C6/36 inoculadas com as excretas demostra que o vírus conserva-se viável. Os resultados sugerem uma possível via secundária potencial para propagação do ZIKV na natureza.

Grande parte da comercialização de camarão em países tropicais é in natura e
realizada através do comércio informal, com precária condição higiênico-sanitária, favorecendo a contaminação
do alimento, principalmente por E. coli e consequente risco de infecção entérica para a população, através da
exposição a cepas virulentas produtoras de ESBL e com relevância para a saúde pública. Objetivou-se a
investigação de genes de virulência e de resistência em isolados de E. coli, obtidos de camarões (Litopenaeus
vannamei), comercializados informalmente, através da identificação fenotípica e molecular. Para tanto, foram
coletadas 22 amostras de camarões (500g, cada). Após maceração e diluição seriada, foi determinado o índice
colimétrico para coliformes totais e termotolerantes e em seguida, o cultivo para isolamento e identificação
fenotípica pelo sistema automatizado (VITEK® 2), bem como o teste para a resistência microbiana. Quanto à
pesquisa dos genes de virulência e resistência realizou-se a reação em cadeia da polimerase para a
caracterização molecular. Foram obtidos 24 isolados de E. coli, sendo 17 cepas comensais (17/24 - 70,8%) e sete
cepas patogênicas (7/24 – 29,2%), incluindo quatro isolados EIEC (4/7 – 57,1%), dois isolados STEC (2/7 –
28,6%); um EHEC do sorotipo O157: H7 (1/7 – 14,3%) e uma híbrida STEC/ETEC (1/7 – 14,3%). O gene
codificador de ESBL CTX-M foi identificado em 25% dos isolados (uma EHEC e cinco comensais). A identificação
de patotipos de E. coli com perfil de resistência em camarões demonstra a circulação de genes e a relevância
para a saúde pública uma vez que contribui para ocorrência de infecções resistentes à abordagem terapêutica,
principalmente em países com fins turísticos, os quais recepcionam pessoas de diversas nacionalidades, o que
ratifica a importância da segurança alimentar para a saúde pública.

Arbovírus (Arthropod-borne virus) são vírus transmitidos através da picada de artrópodes hematófagos e, portanto, responsáveis por causar doenças conhecidas por arboviroses. Com sintomatologia clínica muito semelhante e inespecífica, como febre, dores de cabeça, mialgia e artralgia, as arboviroses representam um grave problema de saúde pública mundial com impactos sociais e econômicos relevantes. Entre os arbovírus brasileiros, os vírus Chikungunya (CHIKV), Dengue (DENV), Febre Amarela (YFV), Mayaro (MAYV), Oropouche (OROV), Rocio (ROCV) e Zika (ZIKV) são responsáveis pela maioria dos casos de arboviroses humanas no Brasil. No entanto, com exceção dos vírus CHIKV, DENV,  YFV e ZIKV, não se tem informações sobre a circulação desses vírus no estado da Bahia. A emergência de arbovírus como CHIKV e ZIKV em centros urbanos do Brasil, ressalta a preocupação com o surgimento de outros arbovírus não encontrados anteriormente em outras regiões do país para além da Região Amazônica. Dito isso, o presente estudo teve como objetivo pesquisar a presença dos arbovírus MAYV, OROV e ROCV em amostras de soro, urina e saliva de pacientes residentes no Estado da Bahia com suspeita clínica de dengue. Esses pacientes manifestaram sintoma febril além de outros sintomas como: artralgia, cefaleia, mialgia, vômito e diarréia. Foram analisadas 554 amostras provenientes de unidade hospitalar privada de Salvador cujos testes para DENV, CHIKV e ZIKV apresentaram-se negativos. RT-PCR e nested-PCR foram realizados para detecção dos vírus MAY, ORO e ROC. Nenhuma amostra foi positiva para MAYV e ROCV e 18 amostras foram positivas para OROV dentre elas 6 de soro, 7 de saliva e 5 de urina. Esta foi a primeira vez que o OROV foi identificado no Brasil fora da região amazônica, no Estado da Bahia e em amostras de saliva e urina. Foi realizado sequenciamento do fragmento do gene codificante para as proteínas N e NSs do OROV de 7 amostras positivas e a análise filogenética mostrou que o vírus presente na Bahia agrupa-se ao genótipo I, o genótipo mais encontrado na Região Amazônica brasileira. A detecção do OROV na Bahia mostra a necessidade de um sistema de vigilância eficiente para controlar a disseminação deste vírus na população. Além disso, este trabalho sugere a utilização de amostras de saliva e urina como alternativa para a detecção de OROV quando amostras de soro são inviáveis.