PGMICRO PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM MICROBIOLOGIA (PGMICRO) INSTITUTO DE BIOLOGIA Téléphone/Extension: Indisponible

Banca de DEFESA: LUCAS BARBOSA DE AMORIM CONCEIÇÃO

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : LUCAS BARBOSA DE AMORIM CONCEIÇÃO
DATA : 27/02/2023
HORA: 14:00
LOCAL: Conferência Web RNP
TÍTULO:

Identificação e Caracterização de Elementos Endógenos Virais em Genomas de Bombus spp.


PALAVRAS-CHAVES:

Abelhas; Elementos Endógenos Virais; EVE; RNAi; Bombus spp.; Partitiviridae; Phasmaviridae; Totiviridae; Virgaviridae.


PÁGINAS: 40
RESUMO:

As abelhas são extremamente importantes para a manutenção de populações vegetais dependentes de polinização, o que reflete em um valor de mercado de 24 bilhões de dólares, corroborando com a produção mundial de mais de US$ 200 bilhões em produção alimentícia. O gênero Bombus se destaca por conter eficientes espécies polinizadoras em culturas de importância comercial e nos ecossistemas naturais em que são nativas. Populações apícolas têm apresentado um declínio preocupante devido às mudanças climáticas, uso de agrotóxicos, parasitas e, principalmente, vírus. Desta forma, há a necessidade de investigação de mecanismos imunológicos que possuam atuar na defesa imune destes organismos, diminuindo a influência de patógenos nas populações. Os RNAs de interferência (RNAi) constituem a principal via de resposta antiviral em artrópodes. Elementos Endógenos Virais (EVEs) de origem não retroviral podem ser transcritos e processados em pequenos RNAs, potencialmente ajudando na resposta imune antiviral em espécies de insetos. A diversidade e atividade transcricional a partir de EVEs já foi comprovada em dípteras, mas existem poucos dados sobre EVEs em abelhas. O objetivo do presente estudo é identificar e caracterizar EVEs presentes em genomas de abelhas do gênero Bombus disponíveis publicamente. Inicialmente, os genomas disponíveis de 30 abelhas (Bombus spp.) foram obtidos do banco de dados Genbank. Após predição de janelas abertas de leitura (ORFs) e subsequente análise de similaridade de sequência contra bancos de dados de sequencias virais, utilizando os programas getorf e DIAMOND, respectivamente, as sequências selecionadas foram submetidas a curadoria manual para exclusão de repetições, sequências similares a retrovírus, transposons, vírus de DNA ou outros organismos não-virais, mantendo somente possíveis EVEs derivadas de vírus de RNA. Subsequentemente, as sequências triadas foram novamente processadas nos blastx e blastn versão online do NCBI para garantir maior robustez dos resultados, e alinhadas entre si para posteriores inferências na história evolutiva dessas EVEs. É possível afirmar que as EVEs apresentaram similaridade, em parte, com 4 famílias virais conhecidas: Partitiviridae, Phasmaviridae, Totiviridae e Virgaviridae; mas em sua grande maioria eram similares a vírus não classificados até então. No geral cada espécie apresentou entre 1-20 EVEs, sendo que não foram identificadas em B. superbus e B. waltoni, e os maiores números de 32, 27 e 25 foram obtidos em B. terrestris, B. polaris e B. vosnesenskii respectivamente. Quando alinhadas umas contra as outras, as sequências demonstraram, em uma grande parte dos resultados, terem similaridade em espécies diferentes, o que pode sugerir uma origem evolutiva comum e antiga, corroborada pelos dados obtidos com o blastn. Em continuidade a este projeto, serão testadas a atividade transcricional das EVEs identificadas e sua possível produção de pequenos RNAs que poderiam influenciar na resposta antiviral das abelhas.

 


MEMBROS DA BANCA:
Externo ao Programa - ***.021.645-** - ERIC ROBERTO GUIMARAES ROCHA AGUIAR - UFMG
Externo à Instituição - LUIZ EDUARDO VIEIRA DEL BEM - UFMG
Externo à Instituição - RODRIGO ARAÚJO LIMA RODRIGUES - UFMG
Notícia cadastrada em: 20/02/2024 16:12
SIGAA | STI/SUPAC - - | Copyright © 2006-2024 - UFBA